20 марта экипаж Дунаевского получил задание ГК КА произвести разведку и сфотографировать результаты бомбометания авиации союзников по Свинемюнде. Погода в районе цели была исключительно сложной, и Дунаевскому приходилось снижаться под облака до высоты 400 м, буквально в самое пекло, где огонь зенитной артиллерии был практически сплошным. Во время третьего полета на разведку Берлина — 22 марта, экипаж сделал три захода на фотографирование площадей в условиях жесточайшего огня зенитной артиллерии. 26 марта, при выполнении подобного задания (разведка аэродромов в районе Берлина), выполнив основную задачу, экипаж по своей инициативе зашел на центр города и сфотографировал западную часть города, доставив исключительно важные данные.
В одном из вылетов в апреле экипаж гв. к-на Остапенко на высоте 7000 м выполнял фотографирование аэродромов в районе Берлина. Сфотографировав Потсдамский аэродром и аэродромы в южной части города, разведчик через центр Берлина направился к северной его части. Экипаж насторожило то, что их не обстреливала зенитная артиллерия и не атаковали истребители противника, а город внизу был покрыт сотнями взрывов. И тут штурман крикнул: «Командир, вверх посмотри, над нами самолеты!» И действительно, над нашим разведчиком проходили около сорока американских бомбардировщиков, которые с высоты 9-10 км бомбили город. Остапенко пришлось быстро развернуться и уйти, но на этом опасности для экипажа не закончились. В 30 км до линии фронта разведчик атаковали три неизвестных двухмоторных истребителя без винтов. Они на бешеной скорости выполнили три безрезультатные атаки (видимо, именно из-за большой скорости открывавшие огонь с больших дистанций и неприцельно). Когда истребители выходили из атаки, за ними оставался черный хвост дыма, и стрелок-радист сначала докладывал, что сбил одного, потом — второго, потом — третьего. Но «сбитые» снова возвращались и снова атаковали. Остапенко уходил из-под атак крутым пикированием, одновременно бросая самолет из стороны в сторону, не давая возможности вести прицельный огонь. И только после того, как разведчик на малой высоте пересек линию фронта — истребители развернулись и ушли на запад. Уже на земле, после посадки разобрались, что их атаковали новые немецкие истребители — реактивные Me 262.
5 апреля 1945 г. за образцовое выполнение заданий командования в боях с немецкими захватчиками при овладении городом Торунь и проявленные при этом доблесть и мужество, полк награжден орденом Суворова 3 степени.
В апреле-мае 1945 г., когда 1-й Белорусский фронт приступил к штурму Берлина, а 2-й Белорусский фронт продолжал наступление в Западной Померании, экипажи полка вели оперативно-тактическую разведку как в интересах Ставки ВГК, так и этих фронтов, а также Командующих 4-й и 16-й ВА. 1-я АЭ гв. к-на Дрыгина, 2-я АЭ гв. к- на Кокарева и 4-я АЭ гв. м-ра Мамонтова с аэр. Торн и Розгов летали на разведку городов, аэродромов, ж/д узлов, оборонительных сооружений, путей отхода и переброски войск по железным и шоссейным дорогам, морских коммуникаций центральной части Балтийского моря, островов Рюген и Борнхольм, портов Свинемюнде, Штральзунд, Росток.
23 апреля 1945 г. полк понес последнюю боевую потерю в Великой Отечественной войне — экипаж Ту-2 1-й АЭ — ком. звена гв. ст. л-т К. Дунаевский, штурман ст. л-т П. Нурпеисов, стрелок-радист гв. ст. с-т С. Кононов, стрелок rb. ст.''с-т М. Панфилов — не вернулся из боевого вылета на разведку Берлина. Уже после войны выяснилось, что в тот полет Дунаевский улетел больным. Полковой врач сообщила в штаб, что Дунаевский по состоянию здоровья лететь не может, но кто-то разрешил, и он со словами: «Как это, без меня Берлин возьмут!» — ушел в последний полет. Позже вспомнили, что от переутомления у командира в полете часто носом шла кровь… Впрочем, списывать все на плохое здоровье командира было бы, разумеется, не вполне правильно. Все хорошо знали, что Дунаевский практически всегда прилетал с заданий с полностью израсходованным боекомплектом — и это было не результатом ожесточенных воздушных боев, а инициативой командира, обстреливавшего с бреющего полета противника (только в феврале-марте 1945 г. он произвел 17 штурмовок). Возможно, какая-то немецкая зенитка в этот раз оказалась удачливее…
3-я АЭ гв. к-на Попова выполняла разведку по вскрытию увода судов из портов Западной Померании, эвакуации этих портов, чтобы определить направления эвакуации. 29 апреля экипаж гв. мл. л-та Рябухина в порту Свинемюнде обнаружил 260 судов, а 30 апреля экипаж гв. ст. л-т Починкова вскрыл в порту Росток свыше 100 боевых кораблей и транспортов. Это были одни из последних боевых вылетов полка в Великой Отечественной войне.
5-я РУ АЭ зимой-весной 1945 г. продолжала подготовку экипажей для ведения воздушной разведки и затем передавала их в боевые эскадрильи.