В сентябре в Карлсхагене в процессе обучения проводились опыты по определению предельных возможностей Fi 103. При этом было достигнуто попадание в цель на максимальной дальности в 225 км, прицельная дальность при полной загрузке составляла всего 75 км. Имела место попытка использовать в качестве носителя Ju 188: два планирующих сброса прошли успешно, в третьем, с запуском ПуВРД, самолет получил повреждения и совершил посадку на брюхо. Продолжения не было.
К 20 октября из 78 экипажей, находившихся в составе КО 53, боеспособными оставались только 24, пришедшие из III./КО 3. Между тем, потери стали расти, англичане ввели патрулирование на ночных истребителях «Москито». 25 сентября сразу четыре «хейнкеля», не успев еще запустить Fi 103, упали в воду Северного моря, сбитые английскими ночниками, через четыре дня потеряли еще два Не 111Н с ракетами.
Полеты и без того проходили с невероятным напряжением. От трех до пяти часов в воздухе летчики проводили в тяжелом спасательном снаряжении. Из-за размещения нагрузки сзади и сбоку центра тяжести, и без того тяжелый на подъем «хейнкель» становился совершенно неповоротливым. Управлять им в полете над самой водой (обычно не выше 50 метров), маскируясь от истребителей, часто в плохую погоду и ночыо было крайне сложно, из-за переутомления пилотов нередко происходили столкновения с водой и аварии на посадке. Напряжение достигало пика, когда самолет приближался к английскому побережью и входил в зону действия радаров. В начинающем светлеть небе «хейнкель» набирал высоту 500 м, сбрасывал летающую бомбу и, заложив крутой вираж, на бреющем, на максимальной скорости уходил назад. «Москито», значительно превосходившие по дальности Не 111 и имевшие полную свободу действий, часто сопровождали немецкие бомбардировщики до своего аэродрома и атаковали их при заходе на посадку, когда казалось, что все опасности уже позади. Так был сбит над аэродромом в Шлезвиге опытный экипаж командира 7-й эскадрильи хауптмана Ессена (hpt. Jessen).
Какой вариант запуска давал больше попаданий — сказать просто невозможно, чаще всего результаты пусков немцам оставались неизвестны. Точная статистика упавших ракет велась англичанами, которые, естественно, не задумывались откуда она прилетела. Несмотря на имеющиеся преимущества, и при воздушном запуске неустойчивая английская погода сильно влияла на точность наведения. Так, например, 24 декабря 50 «хейнкелей» запустили ракеты на Манчестер, из них лишь одна упала на город.
Однако и одна упавшая ракета могла иметь сильнейший психологический эффект. Обычно «хейнкели» освобождались от своей ноши ближе к рассвет)'. На фоне утренних сумерек хорошо различался силуэт приближающейся крылатой бомбы. Затем, как будто выбрав для себя цель, выключив двигатель, она беззвучно устремлялась вниз. Для наблюдателя с земли — картина почти мистическая, казалось нет силы, способной остановить это чудовище, подчиняющееся только своему дьявольскому замыслу.
Немцам и самим довелось убедиться в силе своего оружия. В декабре, когда бензина в эскадре почти не было, в одном из немногих вылетов случилась катастрофа. Бежавший по полосе «хейнкель» с ракетой внезапно исчез в облаке мощного взрыва. Установить причину не представлялось возможным, поскольку от самолета с экипажем ничего не осталось. Уничтожено и повреждено было еще 11 самолетов, аэродром не действовал две недели.
Усилия конструкторов по совершенствованию ракеты и носителя сводились прежде всего к устранению самого узкого места в системе наведения: ошибок пилотов при выходе на точку сброса. С начала ноября задействовали два новых способа наведения: вывод самолета на точку пуска через радиобуй «Schwan» («Лебедь»), который имел УКВ-передатчик и выдавал сигналы на бомбардировщик, и способ, получивший название «Zyklop» («Циклоп»), выведение самолета по радиолучу. К середине ноября три «Циклопа» задействовали в местах Цандвурт, Алкмаар и Ден Хельдер на острове Тексель. Их для пуска ракет на Лондон несколько раз использовала III группа.
К 10 ноября самолетами KG 3 и KG 53 было запущено в общем 1287 ракет. В ноябре количество полетов резко снизилось, а в декабре, несмотря на то, что эскадра достигла пика своей готовности — 85 боеспособных экипажей, масштаб боевых действий зависел теперь исключительно от наличия бензина, а его не было. Помимо уже упоминавшегося, неудачного налета на Манчестер еще дважды группы по 20 самолетов атаковали Лондон.
После Нового года всего два раза самолеты с Fi 103 поднимались в воздух — в ночь с 5 на 6 января, когда «Москито» сбили последний «хейнкель» с подвешенной ракетой, и 14 января, когда на английскую столицу упала последняя ракета, запущенная с носителя.