Годами Борман ожидал возможности свергнуть Геринга. Теперь цель была достигнута, и вопрос о преемнике фюрера был открытым. И все равно, Борман был неудовлетворен. Рейхсмаршал, лишенный всякой власти, оставался все еще жив и свободен. И Борман, на свой страх и риск, передал полковникам Бредову и Франку, командующим СС в Берхтесгадене, радиограмму с приказом арестовать Геринга за государственную измену. «Ответите за это головой», — предупредил Борман.
Около семи часов вечера 23 апреля подразделение СС окружило шале Геринга в Оберзальцберге. Затем Франк и Бредов постучали в дверь, ее открыл камердинер Геринга Роберт Кроп. Угрожая Кропу револьверами, Франк и Бредов взяли Геринга под стражу. Ему не позволили общаться с семьей, подчиненными и внешним миром. Поэтому бывший рейхсмаршал и преемник фюрера не слышал радио Берлина, сообщившее на следующий день о том, что он подал в отставку «по состоянию здоровья».
Фельдмаршал Кейтель был «шокирован», когда узнал факт отставки Геринга от позвонившего в штаб верховного командования, находившегося тогда под Берлином генерала Кребса. Фельдмаршал возмутился, заявив, что это какое-то недоразумение. В этот момент Борман, схватив трубку телефона, прокричал, что Геринг уже уволен с должности «главного егеря рейха». Эти известия привели Кейтеля в крайне удручающее состояние. Это еще больше подчеркнуло «атмосферу отчаяния в рейхсканцелярии и в частности все возрастающее влияние Бормана».
Борман изо всех сил пытался убедить фюрера покинуть Берлин и отправиться в пока еще не тронутые войной окрестности Берхтесгадена. Однако в десять часов утра 25 апреля бомбардировщики союзников провели два удачных налета на резиденцию Гитлера в горах. Его дом, Бергхоф, был разрушен в ходе бомбардировки, продолжавшейся около часа.
Геринг сидел в бомбоубежище возле своего шале, в то время как его до основания разрушили взрывы бомб. Но он не только выжил, но еще и смог убедить своих соратников по СС переправить его в Австрию в замок, которым он владел в Маутерндорфе в трех часах езды от Берхтесгадена.
Рейд авивации также разрушил и дом Бормана. Его жена покинула Берхтесгаден на автобусе со знаком Международного Красного Креста, вместе со своими детьми она вывезла несколько местных ребятишек, которым решила помочь. Остальные сотрудники, переодевшись в гражданскую одежду и выдавая себя за беженцев, добрались до убежища в гористой местности в австрийском Тироле, приготовленном для фрау Борман агентами ее мужа.
Когда французские и американские солдаты вошли в Бергхоф 4 мая, они нашли там опустошенные, еще тлеющие руины. Офицеры разведки, следуя за войсками, искали следы Гитлера и Бормана в окрестностях Оберзальцберга. В суматохе и путанице событий агенты не были уверены в том, что эти двое не покинули Берлин. Гитлер не был найден. Обыск разрушенного дома «Гелль», принадлежавшего Борману, не дал никаких результатов, была найдена только коллекция редких вин, записи классической музыки и множество детских игрушек.
Более поздние попытки разыскать Бормана в Альпах также потерпели неудачу, однако удалось обнаружить чрезвычайно интересные сведения о самом Бормане. Бергхоф скорее принадлежал ему, а не Гитлеру. Вся собственность в Оберзальцберге, состоящая из восьмидесяти семи строений стоимостью более полутора миллиона марок, была официально зарегистрирована на имя Бормана, как и родной дом Гитлера в Браунау и дом его (Гитлера) родителей под Линцем.
В Берлине, в день, когда был совершен авианалет на Оберзальцберг 25 апреля, около часа пополудни, Борман узнал о том, что столица окружена войсками Красной Армии. В этот же день, русские и американские войска встретились на Эльбе в семидесяти пяти милях от Берлина, разделив тем самым Германию на две части. Теперь единственно возможным способом выбраться из Берлина и добраться до немногих мест, где немецкие войска еще вели бои, оставался авиаперелет.