Орудийные башни "Индефатигейбла" имели толщину лобовой плиты, боковых и задней стенок 178 мм, толщина крыши и настила пола в задней части башни составляла 76 мм, как на "Инвинсибле", но подкрепление башен усилили, что в дальнейшем оказалось очень полезным. На "Фон-дер-Танне" орудийные башни имели толщину лобовой плиты и задней стенки 230 мм, боковых стенок 180 мм, наклонной передней части крыши 90 мм, плоской части крыши 60 мм, настила в задней части башни 50 мм.
На "Индефатигейбле" переднюю боевую рубку расположили отдельно, выдвинув достаточно далеко вперед от ходового мостика. Рубка имела толщину лицевой стороны 254 мм, пола и крыши 76 мм. Выходящая из боевой рубки вниз коммуникационная труба со скобами для аварийного выхода имела 102-мм стенку до бро* нированной палубы и вела в нижнюю переднюю боевую рубку. Расположенная в кормовой части задней надстройки боевая рубка управления торпедной стрельбой имела толщину бронирования 25,4 мм.
Между передней боевой рубкой и передней дымовой трубой находилась броневая рубка с постами управления стрельбой главного калибра и сигнальным постом, имевшая 102-мм стенки и 76-мм пол и крышу. Длинная ось поста располагалась поперек продольной оси корабля и в каждом ее закруглении располагались управлявшие артиллерийским огнем офицеры, а в средней части сигнальщики. Бронирование этого поста оказалось недостаточным, а поле зрения ограничивалось спереди передней боевой рубкой, а сзади опорами фок-мачты и надстройкой. Однако такая конструкция поста не повторилась на "Австралии" и "Нью Зиланде", поскольку их построили почти на два года позже "Индефатигейбла". На них на крыше передней боевой рубки установили бронированную рубку поста управления стрельбой главного калибра. При этом мостик значительно нависал над этой рубкой. На мачтах установили увеличенные в длину марсы с дальномерами системы Арго.
На "Фон-дер-Танне" бронирование передней боевой рубки выполнили толщиной 300 мм, ее крыши 80 мм, задней боевой рубки 20С мм и 50 мм соответственно. На "Индефатигейбле" дымоходы прикрыли 25,4-38-мм броневыми плитами, проходящими через главную палубу на уровне полубака. Машинные люки и вентиляционные трубы имели 51-64-мм бронирование, но оно заканчивалось на уровне главной палубы. Броневая защита зарядных и снарядных погребов состояла из близко расположенных к ним со стороны бортов одинаковых 64-мм продольных экранных переборок.
Эту явно недостаточную броневую защиту при постройке следующей пары линейных крейсеров того же проекта ("Австралии" и "Нью Зиланда") определенным образом модифицировали. С носовой и кормовой оконечности сняли 51-мм броневые плиты, оставив только 13- мм стенку борта, а 127-152-мм броневые пояса в районе барбетов башен "А" и "Y" удлинили 102-мм полосой брони небольшой протяженности, однако не доходящей до носовой и кормовой оконечностей. По концам 102-мм броневого пояса до главной палубы установили поперечные прямые 102-мм переборки, причем передняя продолжалась толщиной 38-мм между главной и нижней (бронированной)палубами.
При этом они отличались от "Индефатигейбла" следующими особенностями: 152-мм главный броневой пояс длиной 144,2 м (80,4% длины по ватерлинии) заканчивался в 18,3 м от носовой оконечности и в 16,8 м от кормовой, соединенный в носовой и кормовой частях корабля поперечными броневыми переборками.
Броневой пояс увеличили со 102 мм до 127 мм в районе барбетов "А" и "Y" и полосами с 64 мм до 102 мм впереди барбета башни "А" и позади барбета башни "Y"; верхнюю часть носовой поперечной переборки уменьшили с 76 мм до 38 мм и кормовой со 114 мм до 102 мм, но кормовую поперечную переборку расположили значительно дальше к корме, чем на "Индефатигейбле".
Бронирование главной палубы простиралось только на 16,8 м от кормы, в то время как раньше оно продолжалось до барбетов. Нижнюю палубу в носовой и кормовой оконечностях увеличили с 51 мм до 64 мм; пост управления артиллерийским огнем центральной наводки расположили наверху передней боевой рубки (на "Индефатигейбле" он находился в верхней задней части передней боевой рубки) и толщину бронирования поста увеличили с 76-102 мм до 76-152 мм.