Особенно много работы выпало на долю ледокола в последние дни 1939 г., когда к сложной ледовой ситуации прибавилась и напряженная метеорологическая – сорокаградусные морозы и снежная пурга. Обстановка, в которой действовал «Ермак», усложнялась еще и тем, что после возвращения из Арктики на нем имелся некомплект команды, и «добирать» ее пришлось с различных кораблей и судов. Как отмечено в представлении к наградам личного состава «Ермака», подписанном комендантом и военкомом ледокола, «явно неудовлетворительно было положение с военнослужащими – мл[адшими] командирами и краснофлотцами. Люди были прикомандированы из 8–9 различных частей, преимущественно с новостроящихся кораблей, т. е. многие из них за свою службу на флоте не сделали ни одного выстрела из пушки, с низкой выучкой и натренированностью. По количеству далеко недостаточно: вместо минимума в 70–80 человек, всего 24 человека, что не хватало для укомплектования зенитных орудий даже одного борта. В орудийные расчеты пришлось включить вольнонаемный состав, особенно служивших ранее в Красной Армии. Много людей было призвано из запаса, очень или даже совсем не обученных. Недостаток людей вынуждал во время отражения налета авиации противника перебрасывать орудийные расчеты с борта на борт»[329].
В этом же документе довольно подробно говорится об участии «Ермака» в боевых действиях. «Только за 6 дней, с 25 по 31 декабря, проведены две ответственные операции. Выведены в море советские и иностранные пароходы, военные и вспомогательные корабли КБФ. Приведены в Главную базу и Ленинград ряд военных и торговых кораблей. Всего до сорока кораблей. Выполнена большая и ответственная работа по освобождению из льда большого количества военных кораблей, миноносцев, тральщиков, канлодок, учебных кораблей, вспомогательных судов, буксиров, транспортов, всего тоже до нескольких десятков. Операция проведена блестяще, без всяких потерь и очень своевременно, так как начавшиеся в первой половине января штормовые ветры зюйд-вестового направления вызвали подвижку льда и сильное сжатие, что могло привести к катастрофическим последствиям»[330]. С 30 декабря 1939 г. по 3 января 1940 г. «Ермак» обеспечивал проводку линкора «Октябрьская революция» при неудачной попытке обстрелять береговую батарею Сааренпя на острове Биорке.
Затем 10 января «Ермак» совместно с ледоколами «Силач» и «Трувор» принял участие в проводке эсминца «Энгельс», канонерской лодки «Красное Знамя» и транспорта «Горняк» к острову Гогланд. Следуя шхерным фарватером в условиях плохой видимости, «Ермак» сел на мель между островами Сескар и Пенисаари и получил повреждения по днищу всего левого борта. Благодаря общим усилиям экипажа судно удалось снять с мели. Пробоина была временно заделана, и «Ермак» продолжил работу. Во время этого же похода 13 января ледокол пытались атаковать самолеты «Райпон» из состава 26-й финской морской эскадрильи. Через три дня по «Ермаку» пытался отбомбиться пикировщик «Фоккер» C.X. с бортовым номером FR-80, но также не смог добиться результата.