Уже в мае-июне 1918 года в Баку начинает формироваться турецко-азербайджано-дагестанское военное формирование (Кавказской исламской армии). Численность этой армии составляла от 16 до 18 тысяч. Турецкие военнослужащие составляли лишь треть, а остальные были азербайджанскими ополченцами, которым недоставало военной подготовки.
Руководство операцией по взятию Баку было возложено турецким командованием на Нури-пашу, который 4 мая прибыл в Тебриз, а оттуда с группой офицеров в Елизаветполь (Гянджу), где на базе 5-й Кавказской дивизии планировалось сформировать Кавказскую исламскую армию под командованием Нури-паши. На территории Азербайджана было введено военное положение. Национальный совет Азербайджана обратился за военной помощью к Турции, которая задействовала в этих целях Кавказскую исламскую армию под командованием Нури-паши, в состав которой вместе с прибывшими 5-й Кавказской и 15-й Чанахгалинской турецкими дивизиями вошел Мусульманский корпус, сформированный правительством АДР.
4 июня делегация АДР в Батуме подписала договор о дружбе и сотрудничестве с Османской империей, согласно которому Османская империя обязывалась «оказывать помощь вооруженной силой правительству Азербайджанской Республики, если таковая потребуется для обеспечения порядка и безопасности в стране». Турецкое командование заявило, что «сотни тысяч тюрков и мусульман терпят в Баку и окрестностях кровавое ярмо безжалостных бандитов, так называемых революционеров».
Буквально через два дня после подписания договора Народный комиссар по военным и морским делам Бакинского СНК Григорий Корганов отдал войскам Бакинской коммуны приказ о наступлении на Елизаветполь (Гянджу). Части Кавказской Красной армии общей численностью до 13000 человек выступили вдоль Закавказской железной дороги по направлению к Елизаветполю. Они с боем взяли станцию и село Кюрдамир, через неделю – достигли селения Карамарьям. Бакинский Совнарком отправил телеграмму председателю СНК РСФСР В. И. Ленину: «Настроение в наших войсках бодрое, порядок образцовый, наши армия и флот будут героически отстаивать Советскую власть». Большая часть солдат и практически все командиры являлись армянами, поддерживавшими партию Дашнакцутюн или являвшимися ее членами.
В боях под Геокчаем 27 июня – 1 июля 1918 года части Кавказской исламской армии разбили 1-й Кавказский корпус Красной армии, части которого отступили под Карамарьям. Инициатива полностью перешла к Кавказской исламской армии. Линия фронта стала быстро приближаться к Баку. Правительство Советской России пыталось убедить Германию остановить наступление турецких войск, что следует из телеграммы Ленина Сталину от 30 июня. Хотя договоренность между большевиками и германским правительством были юридически оформлена 27 августа 1918 и включена статьей 14 к Брест-Литовскому мирному соглашению, но у Германии не было реальных возможностей повлиять на ситуацию в регионе. Турецкое командование продолжило наступление на Баку, не взирая на сопротивление отрядов Терского казачьего войска, примкнувшего к большевикам.
31 июля Бакинский Совнарком заявил о сложении своих полномочий и принял решение эвакуировать военные силы и государственное имущество Советской России на пароходы. Большевистское руководство Баксовета и комиссары вместе с большевистскими вооруженными отрядами и имевшимся в их распоряжении вооружением погрузились на пароходы, чтобы выехать в Астрахань, которая находилась в руках большевиков. Однако вечером того же дня по приказу правительства Диктатуры Центрокаспия, взявшая власть в Баку 1 августа, остановило пароходы. Однако новая власть в Баку, сформированная на базе блока правых социалистов-революционеров, социал-демократов (меньшевиков) и дашнаков (армян), также была не в силах остановить Кавказскую исламскую армию.
Вскоре бакинские комиссары предприняли еще одну попытку отъезда в Астрахань. Однако вышедшие из Баку семнадцать пароходов с красноармейцами и военным снаряжением были насильно возвращены в военный порт, где большевистские части были разоружены, а позднее на этих же судах отправлены в Астрахань. Бакинские комиссары и другие большевистские активисты во главе с Шаумяном были арестованы и заключены в тюрьму.
2.8. Мирный договор 1921 года и потеря Карской области России