Осенью начались занятия. Разбитые поротно, юнкера не так быстро сходились друг с другом, как это бывало в других училищах. Слишком разношерстным был набор в инженерное училище по сравнению с пехотным. Например, в Павловском одна рота целиком состояла из выпускников Петербургской военной гимназии. Система преподавания резко отличалась от гимназической. Лекционно-семинарский метод, казалось, представлял неограниченную свободу обучаемому, но предполагал серьезную самостоятельную работу. Роман приступил к занятиям, отметив, что профессора не только не превосходят полоцких учителей, но и по некоторым вопросам уступают им. И только серьезный анализ заставил его изменить отношение к лекциям. Он стал внимательнее, старался подробней записывать за профессором, и вскоре ему стало ясно, что он ошибался в оценке преподавания. Действительно, материал на лекциях давался более углубленный, примеры приводились сложнее. Словом, гимназией здесь не пахло. Особенно это относилось к алгебре, геометрии, физике и истории. Что же касается фортификации, артиллерии, топографии, то они были совершенно новыми для Романа предметами.
В начале декабря училище посетил великий князь Николай Николаевич, военный министр Милютин и генерал Тотлебен. Роман с волнением ожидал встречи с героем Севастополя, легендарным человеком, автором книги, толкнувшей его на саперное поприще. Гостей встречало все училище в парадном строю, с развернутыми знаменами и встречным маршем. Высокий, импозантно выглядевший в гвардейской форме брат царя, затмил всю свиту, невзрачного на вид военного министра и изрядно постаревшего севастопольского инженера. Разглядеть внимательно своего кумира Роман смог только на торжественном молебне. Старый генерал, заметно погрузневший, стоял по левую руку от великого князя, опустив на грудь большую полысевшую голову. Прикрыв глаза, он едва шевелил пушпстыми моржовыми усами, истово крестился и не обращал ни на кого внимания.
Высокие гости обошли все помещения училища, ненадолго задержались в библиотеке, где Милютин живо интересовался наличием военной и специальной литературы, уставов и наставлений. Гости присутствовали в старшем классе на лекции по обороне крепостей. Визит по длительности не занял и трех часов, но впечатлений у юнкеров оставил много. Вечером в актовом зале и на следующий день во время свободного урока они обсуждали его, делали разные предположения о причинах этого посещения.
Многие ставили этот визит в связь с военной реформой. И все пришли к выводу, что роль инженерных войск повысится. Милютин пользовался у юнкеров Николаевского инженерного училища особым уважением как военачальник, придававший инженерному обеспечению войск в современном бою большое значение. По его инициативе перерабатывалось наставление по боевому применению саперных войск, справочник офицера. По-новому определялось место и роль саперных рот и батальонов в бою. Юнкера видели в этом добрые предзнаменования и для будущей своей службы, и для повышения авторитета саперных войск вообще. Относительно Тотлебена все сошлись во мнении, что старик уже себя изжил. И только Кондратенко по-прежнему считал его гением, способным еще принести пользу армии.
В это же время Роман Кондратенко встречается с братом Николаем, который вернулся из Туркестанского похода глубоко разочарованным в жизни и службе. Состояние это объяснялось не только тяжестями перенесенного похода, но и непониманием большей частью общества всей сложности борьбы за окончательное закрепление за Россией Средней Азии. Впервые услышал Роман от брата и имя Михаила Дмитриевича Скобелева, уже тогда прославившегося, а впоследствии по праву заслужившего звание героя освободительной войны на Балканах.
Приближалось Рождество, а с ним и экзамены. Лекций было мало, но Роман занимался основательно, и свободного времени у него не оставалось. Однако он успевал читать книги, ходить по городу, посещать столичные театры. Здоровая, спокойная жизнь, постоянные занятия гимнастикой, к которой в эту зиму Роман особенно пристрастился, подействовали на него самым благотворным образом. Он возмужал, окреп, раздался еще больше в плечах. Ухо почти не болело, хотя слышал им он по-прежнему плохо. Небольшого роста, слабый в кости Роман в гимнастическом зале выглядел теперь настоящим атлетом. Жизнь радовала юношу, и он с удовольствием писал домой:
«…Я по-прежнему здоров и твердо иду к избранной цели; ряд занятий по всевозможным предметам, гимнастические упражнения, сон — смотришь, суток, как не бывало. И так идет изо дня в день, чрезвычайно быстро. Вообще в этом отношении военно-учебные заведения очень хороши: они всегда так ловко распределяют время, что положительно не знаешь, каким образом оно могло так скоро пройти».
Рождество Роман Кондратенко встречал в прекрасном настроении, здоровым и уверенным в себе. Домой, как из Полоцка, пошел подробный отчет с оценками за полугодие. Они вновь были отличными.