Большую часть карьеры он сделал в инженерных войсках. Но известность получил, работая начальником специального штаба «W», во время гражданской войны в Испании. В 1938 году он служил начальником штаба инспекции крепостей. После всевозможных назначений в инженерных частях в Польше, Бельгии, Париже и на Западном фронте на протяжении первых трех лет войны Йенеке 1 ноября 1941 года был произведен в генерал-лейтенанты. Его дорога к Сталинграду началась в феврале 1942 года, когда в Праге он принял командование 389-й пехотной дивизией. В мае она вошла в состав 6-й армии и принимала участие в боях под Харьковом. Его старый приятель Паулюс, после того как с поста командующего IV корпусом был уволен Швельдер, назначил на это место Йенеке. Благодаря Паулюсу Йенеке 1 ноября 1942 года был произведен в генералы инженерных войск.
Казалось, генералу Йенеке придется разделить участь своих многочисленных соратников по Сталинграду, однако в последние дни осады он нашел выход. Имеется две версии его таинственного спасения. Согласно первой, он был ранен шрапнелью и с 16 ранами был эвакуирован.[110] Вторая версия — куда менее героическая. Согласно ей, в здание, где скрывался генерал, угодил советский снаряд, при этом от стены откололся кусок штукатурки и попал генералу в голову, разбив ее в кровь. Йенеке, не долго думая, при первой же возможности эвакуировался как раненый. Он оставался в госпитале до полного «выздоровления». Говорят, что, если бы Гитлер или кто-то другой из его ближайшего окружения узнали бы, как незначительна была рана Йенеке, то ему вряд ли удалось бы пережить Сталинградскую кампанию.[111] К марту он совершенно поправился и 1 апреля взял на себя командование LXXXVI корпусом, располагавшимся в ту пору на юго-западе Франции.[112] 1 июня 1943 года Йенеке был назначен командующим 17-й армией, воевавшей в Крыму, а 30 января 1944 года был произведен в генерал-оберсты.
Вполне понятно, что руководить еще одним Сталинградом Йенеке совсем не хотелось. По мере продвижения к Крыму советских войск он все настойчивее требовал скорейшего оставления полуострова и даже провел ряд мер по подготовке эвакуации. Это едва не привело в конце октября 1943 года к отстранению его от командования армией и назначению на его место фельдмаршала Эвальда фон Клейста. После того как в результате советского наступления в ноябре того же года Крым оказался отрезан, Йенеке продолжал обращаться к командованию группы армий, ОКХ и фюреру с просьбой разрешить эвакуацию 17-й армии морем. Но, как в случае со Сталинградом, Гитлер отказал.
7 апреля 1944 года три советские армии, в составе которых было 27 дивизий и 200 танков, атаковали позиции Йенеке на Перекопском перешейке и в районе Керчи. Йенеке, располагавший всего 5 недоукомплектованными германскими дивизиями и 7 румынскими (которые не отличались высокой боеспособностью), начал 10 апреля планомерное отступление, чем привел Гитлера в дикую ярость. Фюрер кричал, что Йенеке совершенно потерял голову. Но командующий 17-й армией был не в силах удержать промежуточные оборонительные рубежи и продолжил отступление до Севастополя, цитадели на юго-западе Крыма.
28 апреля Гитлер вызвал Йенеке в Берхтесгаден и пообещал ему «щедрое» подкрепление. Но когда Йенеке узнал, что это означало четыре батальона новобранцев, которые даже не успели пройти полный курс боевой подготовки, то решил возложить ответственность на плечи истинного виновника надвигавшегося несчастья (Гитлера), предложив переподчинить 17-ю армию непосредственно ОКХ. После этого Йенеке был отстранен фюрером от командования.[113]
Штурм Севастополя советское командование начало 5 мая, а к 12 мая были подавлены последние очаги сопротивления. Около 26 700 немцев сдались в плен. Части, которые успели эвакуироваться, должны были сдать все свое снаряжение. Они были расформированы и подверглись полной реорганизации.
Гитлер приказал не назначать Йенеке на командную должность до тех пор, пока военный трибунал не разберется, сделал ли он все возможное, чтобы удержать Крымский полуостров. Трибунал так и не был созван, но и нового назначения Йенеке не получил.
В январе 1945 года, когда Йенеке осознал, что конец Германии не за горами, он направил Гитлеру личное письмо, в котором изложил положение рейха и выразил надежду, что фюрер сделает правильные выводы. 31 января 1945 года Йенеке был изгнан из рядов армии. Проживая в восточной части Германии, 11 июня 1945 года он был арестован русскими и депортирован в Чехословакию, где был судим как военный преступник и приговорен к 25 годам лишения свободы.[114] В 1955 году он вышел из заключения и в 1958 году еще жил в Кельне, в полном забвении.