На следующий день после открытия первого Съезда народных депутатов СССР, 26 мая 1989 г., еще «коммунистический» парламент Литовской ССР принял «Декларацию о государственном суверенитете Литвы». Тогда же единогласно были приняты поправки к конституции Лит. ССР, рекомендованные «Саюдисом». Согласно этим поправкам в республике главенствовали местные законы, вводилось литовское гражданство, земля объявлялась собственностью республики. Отношения Литвы с другими государствами, в том числе и СССР, с этой поры должны были регулироваться только на основе межгосударственных соглашений.
Это был чистой воды сепаратизм, за который в США любой получил бы 20 лет тюрьмы и огромный денежный штраф. В СССР законы, подобные американским, отсутствовали. Однако согласно статье 74 Конституции СССР 1977 г. на территории Союза ССР верховенство имели законы СССР, а статья 75 гласила о том, что «Территория Союза Советских Социалистических Республик едина и включает территории союзных республик». Нарушение этих статей было достаточным основанием для возбуждения уголовных дел против лидеров «Саюдиса».
Горбачев вновь сделал вид, что в Литве ничего особенного не происходит. Более того, для народных депутатов СССР из Литвы был создан, если можно так сказать, льготный режим. Они, представители республики, провозгласившей суверенитет, заняли места в Кремлевском дворце съездов и получили, благодаря телевидению, всесоюзную трибуну и многомиллионную аудиторию.
С первых дней работы Съезда народных депутатов СССР 58 избранников от Литвы поставили себя в особое положение. Заметим, что все литовские депутаты были под сильнейшим прессингом «Саюдиса». Шаг вправо, шаг влево рассматривался как национальная измена.
Саюдист-«коммунист» А. Чекуолис в интервью газете «Вечерние новости» (от 23.05 1989 г.) заявил: «…депутаты от Литвы — сплоченная группа, отстаивающая единую политику. Другой такой сплоченной группы нет на всем съезде народных депутатов СССР. Поэтому, несмотря на нашу малочисленность, мы пользуемся большим уважением. Все поглядывают на нас с завистью и ищут благосклонности. Но мы не намерены вообще продавать ее или легко отдавать…
Договорились о тактике при голосовании. Если не сможем победить, то встанем и удалимся…».
На первом Съезде литовские депутаты соблюдали некоторую лояльность, заявляя о своей приверженности перестройке. Но сепаратисты всех мастей в Союзе получили возможность на примере прибалтийских депутатов наблюдать, как следует противостоять центральным властям. Фактически телевидение демонстрировало своеобразный курс политического ликбеза, который впоследствии очень дорого обошелся стране.
30 мая 1989 г. на Съезде выступил народный депутат СССР, тогдашний Первый секретарь ЦК, пока единой, Компартии Литвы Альгирдас Бразаускас. Он заявил, что существующая Конституция СССР «тормозит путь самостоятельных республик в перестройку». Также он поставил вопрос о признании секретных протоколов к советско-германскому договору 1939 г. недействительными. Это был коренной вопрос для «саюдистов», ради которого они стали народными депутатами. 7 июня 1989 г. на съезде выступила народный депутат СССР, премьер-министр Литвы Казимира Прунскене, которая изложила концепцию экономической реформы в Литве и странах Балтии в рамках Союза. Но это было камуфляжное выступление.
В этот момент «Саюдис» решил провести генеральную репетицию по выводу Компартии Литвы из КПСС. Объектом был выбран литовский комсомол, который уже именовался не ленинский, а просто коммунистический союз молодежи Литвы (КСМ). В июне 1989 г. состоялся XXII съезд КСМ. Съезд принял декларацию, в которой говорилось: «15 июня 1940 г. Красная Армия перешла границу независимой Литовской Республики. Это был акт насилия, несовместимый с нормами международного права. Мы, делегаты XXII съезда КСМ Литвы, осуждаем оккупацию и аннексию Литвы в 1940 г. и требуем предоставить условия свободного самоопределения Литвы».
На этом съезде молодежное коммунистическое движение в Литве закончилось. Несмотря на призывы руководства КСМ вступать в новый союз молодежи, после съезда из полумиллионного отряда литовских комсомольцев перерегистрировались всего 890 человек.
В это время Литву постоянно сотрясали саюдистские информационные «бомбочки». 22 августа 1989 г. комиссия Верховного Совета Лит. ССР по изучению германо-советских договоров 1939 года и их последствий опубликовала свое заключение, суть которого была в следующем: Декларация о вступлении Литвы в состав СССР» и Закон СССР «О вступлении Литовской Советской Социалистической Республики в Союз ССР» от 3 августа 1940 г. являются незаконными.