В 1584 году Обществом Иисуса была образована особая комиссия, которая в течение года на основе идей Лойолы разработала программу преподавания в иезуитских коллегиях – «Partio atque Institutio Studiorum Societatis Jesu». Орден в первую очередь был духовной силой, действовавшей с профессорских кафедр, проповедовавшей и исповедовавшей. Общество Иисуса в своей основе была организацией ученых, преподавателей и студентов. Два из трех учреждений ордена были коллегиями, четыре из пяти его членов студентами или преподавателями. Орден всегда был сосредоточен на высшем образовании, школьное обучение проводили многочисленные миссии. Ученики жили в интернатах для бедных и пансионатах для дворян, в семинариях для священников. Число учеников в иезуитских учебных заведениях было огромно и измерялось сотнями тысяч. В знаменитой римской коллегии училось более двух тысяч студентов. При генерале Аквавиве в 1599 году был разработан всеобъемлющий школьный закон, названный современниками великим. Орден иезуитов и как школьный, студенческий орден, пользовался невероятным успехом. Учиться в иезуитской коллегии было престижно и почетно и многие родители стремились отдать туда своих детей.
Многие преподаватели и учителя других светских и духовных заведений на всех углах кричали, что Общество Иисуса лишило их куска хлеба, забывая, конечно, выкрикивать, что всегда, везде и всех иезуиты учили бесплатно. До образования ордена духовных рыцарей учиться мог один из ста желающих, при них – все, кто этого хотел. Иезуиты быстро и успешно меняли лицо Европы. Орден расходовал огромные суммы на содержание коллегий, семинарий, университетов. Всем было известно, что лучшие учителя и преподаватели – иезуиты, и самого Игнатия Лойолу по праву называли великим педагогом. Протестантские школы сохраняли много индивидуализма в учебной программе. В иезуитских коллегиях стремились к единообразному универсализму. У иезуитов все студенты стремились быть лучшими и в полученных знаниях конкурировали друг с другом и класс с классом. Каждый месяц и год проходили соревнования по разным предметам, существовал рейтинг успеваемости студентов. В коллегиях постоянно шли соревнования по всем предметам, диспуты, драматические представления, поэтические вечера, торжественные церемонии. В коллегиях существовали братства, следившие за религиозной жизнью и развитием учащихся. На периодических собраниях студенты обсуждали свои поступки и ошибки. В протестантских школах специально не учили хорошим манерам и умению держать себя в обществе. В иезуитских коллегиях этому придавали большое знамение, отдавая много сил и времени прививанию культуры, от носового платка до правильных оборотов речи: «в человеке все должно было быть прекрасным: и лица, и одежда, и душа, и мысли». В протестантских школах кормили скудно. В иезуитских коллегиях студенты питались, как молодые дворяне или дети богатых горожан. Занятия шли не более шести часов в день, каждое – не более двух часов подряд, с перерывами. Устав запрещал заниматься науками во время, предназначенное для отдыха и сна: «Работая умеренно, с соблюдением равновесия сил, человек будет в состоянии трудиться более долгое время во славу Божию». Учителя и преподаватели специально следили за тем, чтобы их воспитанники проводили много времени на свежем воздухе. Школьный и университетский курсы постоянно совершенствовались – Лойола несколько раз говорил, что регламентация учебы во всех ее деталях ведет к ее убийству.