С началом Великой Отечественной войны в июне 1941 г. был направлен во вновь формировавшуюся Киевскую особую авиагруппу ГВФ. На самолете ПС‐84 совершал боевые вылеты в интересах Юго-Западного фронта, доставлял продовольствие в осажденный Ленинград. Командир корабля ПС‐84 8‐го отряда Киевской особой авиагруппы ГВФ П.П. Савченко к 5 февраля 1942 г. совершил 28 ночных вылетов в глубокий тыл противника, выбросил 164 парашютиста, перевез 289 бойцов и командиров, 300 прочих пассажиров, 44 тонны боеприпасов, 37 тонн грузов для нужд фронта, 29 тонн листовок. Неоднократно подвергался обстрелу зенитной артиллерией, но всегда уходил, сохраняя самолет и экипаж.
C апреля 1942 г. воевал в 103‐м тап, который в июле 1942 г. был включен в состав 1‐й ад дд и получил наименование 103‐го ап дд. П.П. Савченко был зачислен в кадры Красной армии, получил звание старшего лейтенанта и должность заместителя командира эскадрильи. На Северо-Западном фронте в июне 1942 г. выполнил 11 боевых вылетов по доставке в сложных метеоусловиях в район поселка Новая Кересть (Новгородская область, Новгородский район) войскам окруженной 2‐й ударной армии продовольствия, боеприпасов и медикаментов.
С августа 1942 г. участвовал в обороне Сталинграда. С полевого аэродрома у озера Эльтон наносил бомбовые удары по вражеским войскам, рвавшимся к Сталинграду, железнодорожным станциям, подходящим резервам, а с сентября – по передовым позициям противника в южной и центральной части Сталинграда, выбрасывал десанты в тылу врага. К концу ноября на Сталинградском фронте совершил 69 боевых вылетов. Во время контрнаступления советских войск под Сталинградом в ноябре – декабре 1942 г. в составе своего полка капитан П.П. Савченко доставлял горючее и боеприпасы наступавшим войскам Юго-Западного фронта, в том числе танкистам 7‐го танкового корпуса генерал-лейтенанта П.А. Ротмистрова. Во время блокады окруженной вражеской группировки 103‐го ап дд наносил удары по аэродромам базирования транспортной авиации Сальск, Большая Россошка, Карповка, Гумрак, Тацинская, Морозовск, Суровикино, с помощью которой противник пытался снабжать окруженные войска. 26 марта 1943 г. 103‐й ап дд был преобразован в 12‐й гв. ап дд. Входил в состав 12‐й ад дд. С марта по август 1943 г. полк бомбил железнодорожные узлы, укрепленные позиции врага, участвовал в воздушных операциях по уничтожению авиации противника на его аэродромах, уничтожал его оперативные резервы.
Во время битвы на Курской дуге полк участвовал в июле 1943 г. в заключительном этапе сражения – Орловской наступательной операции. В августе 1943 г. П.П. Савченко в составе дивизии участвовал в Мгинской наступательной операции Ленинградского фронта – разгроме мощного долговременного узла сопротивления противника в районе Синявино – Мга. До 20 сентября 12‐й гв. ап дд участвовал в бомбардировке долговременных узлов обороны гитлеровцев в районе города Духовщина Смоленской области, поддерживал наступление Красной армии на смоленском направлении.
25 сентября 1943 г. полк участвовал в выброске крупного десанта на Воронежском фронте за Днепр, в район юго-западнее Переяславля. Одновременно с бомбардировочными ударами по войскам и резервам противника, по аэродромам и железнодорожным узлам весной и летом 1943 г. экипажи 12‐го гв. ап дд совершали большое количество боевых вылетов в партизанские отряды и соединения Белоруссии, Украины, Брянской, Смоленской и других областей, в том числе в соединения С.А. Ковпака и А.Н. Сабурова. Летчики на Ли‐2 доставляли партизанам вооружение, боеприпасы, медикаменты, вывозили раненых, больных, детей. В этих полетах П.П. Савченко принимал активное участие.
В начале октября 1943 г. майор П.П. Савченко был переведен в 110‐й ап дд той же 12‐й ад дд (7‐й ак дд). В ночь на 16 октября 1943 г. во время боевого вылета самолет П.П. Савченко подвергся нападению вражеских истребителей и в воздушном бою был сбит. Экипаж погиб. К 16 октября 1943 г. П.П. Савченко совершил 503 боевых вылета в глубокий тыл противника на бомбардировку скоплений войск, железнодорожных узлов и аэродромов, складов боеприпасов, водных переправ, доставку грузов и боеприпасов партизанам, из них 235 – на доставку боеприпасов и горючего днем наступающим войскам. Общий налет составил 5005 часов.
Указом ПВС СССР от 13 марта 1944 г. за мужество и героизм, проявленные при выполнении боевых заданий командования, Савченко П.П. присвоено звание Героя Советского Союза (посмертно).
Награжден 2 орденами Ленина (31.12.1942; 13.03.1944), орденами Красного Знамени (23.02.1942), Отечественной войны 2 степени (19.08.1942), медалями.
Родился 1 (14) июня 1914 г. в г. Якутск. В Красной армии с 1934 г. В 1937 г. окончил Энгельсскую военную школу лётчиков. Участник освободительного похода советских войск в Западную Украину и Западную Белоруссию 1939 г., советско-финляндской войны 1939–1940 годов.