12-й отдел (Главное управление формирований и комплектования Красной Армии).
На 30 июня 1942 года расстановка начальствующего состава и структура Управления особых отделов выглядела так:
Руководство (В. С. Абакумов, С. Р. Мильштейн, Ф. Я. Тутушкин, Н. А. Осетров, Л. Ф. Цанава).
Секретариат (Я. М. Броверман).
Оперативное отделение (А. В. Миусов).
Следственная часть (Б. С. Павловский) в составе трех отделений:
1-е отделение – по шпионажу;
2-е отделение – по антисоветским формированиям;
3-е отделение – по руководству следственной работой на периферии.
1-й отдел (И. И. Москаленко) в составе трех отделений:
1-е отделение – по оперативному управлению Генерального штаба, штабам фронтов и армий;
2-е отделение – по всем другим управлениям и отделам Генштаба;
3-е отделение – по Главному разведывательному управлению Генштаба, разведорганам фронтов и армий.
2-й отдел (А. А. Авсеевич) в составе пяти отделений:
1-е отделение – по штабу ВВС;
2-е отделение – по вооружению и тылу ВВС;
3-е отделение – по Академии ВВС и периферийным частям ВВС;
4-е отделение – по ПВО;
5-е отделение – по ВДВ.
3-й отдел (В. П. Рогов) в составе трех отделений:
1-е отделение – по Главному автобронетанковому управлению Красной Армии, управлениям фронтов, армий, танковых армий, корпусов и бригад;
2-е отделение – по артиллерийским управлениям фронтов, артотделов армий, артиллерии Резерва Верховного Главнокомандования, Управлению Гвардейских минометных частей, гвардейским минометным частям;
3-е отделение – по Главному артиллерийскому управлению Красной Армии.
4-й отдел (Г. С. Балясный-Болотин) в составе четырех отделений:
1-е отделение – по руководству агентурно-оперативной работой особых органов (по родам войск) на Карельском, Ленинградском, Волховском, Северо-Западном, Калининском фронтах, в 7-й отдельной армии[28], резервных армиях;
2-е отделение – по руководству агентурно-оперативной работой особых органов (по родам войск) на Западном, Брянском[29], Юго-Западном, Южном, Северо-Кавказском[30] фронтах;
3-е отделение – по борьбе с изменой, дезертирством, самострелами, организации заградительной службы;
4-е отделение – по редакциям военных газет, органам военной прокуратуры, военным трибуналам, военным академиям, Центральному дому Красной Армии.
5-й отдел (К. П. Прохоренко[31]) в составе двух отделений:
1-е отделение – по Главному интендантскому управлению Красной Армии, управлениям фронтов, интендантским отделам армий, Управлению снабжения горючим;
2-е отделение – по Главному санитарному управлению Красной Армии, Ветеринарному управлению, фронтовым и окружным сан– и ветслужбам, Главному автодорожном управлению, Главвоенстрою, Военпроекту (академии).
6-й отдел (С. П. Юхимович) в составе четырех отделений:
1-е отделение – по пограничным войскам и учебным заведениям войск НКВД;
2-е отделение – по внутренним войскам и войскам ох раны тыла фронтов;
3-е отделение – по железнодорожным, промышленным и конвойным войскам;
4-е отделение – по органам военного снабжения войск НКВД.
7-й отдел (А. Ф. Соловьев) в составе двух отделений:
1-е отделение – по действующему учету управления особых отделов, отчетности фронтовых особорганов, учету изменников, шпионов, диверсантов, террористов, паникеров, дезертиров, самострельщиков и антисоветских элементов, особому учету изменников Родины, агентов разведки и лиц, скомпрометированных по показаниям последних;
2-е отделение – по проверке номенклатуры ЦК ВКП(б), НКО, НКВМФ, шифроработников, допуску к секретно-мобилизационной работе, проверке командируемых за границу и личного состава Красной Армии и Военно-Морского Флота.
8-й отдел (М. П. Шариков) в составе двух отделений:
1-е отделение – шифровальное;
2-е отделение – по агентурно-оперативному обслуживанию шифроорганов Красной Армии, инспектированию шифроорганов особых отделов, учету и пересылке шифров.
9-й отдел (П. А. Гладков[32]) в составе двух отделений:
1-е отделение – по Главному морскому штабу, Разведуправлению ВМФ, Школе Разведупра, управлениям наркомата, частям и учреждениям НК ВМФ центрального подчинения и их периферийным объектам;
2-е отделение – по управлению, штабу, узлу связи ВВС ВМФ, управлению ПВО ВМФ;
10 отдел (И. И. Горгонов[33]) – по руководству контрразведывательной работой особых органов фронтов и округов;
11 отдел (А. Е. Кочетков) – по инженерным и химическим войскам, саперным армиям, оборонительного строительства и войскам связи;
12 отдел (П. М. Чайковский) – по Главному управлению формирований и комплектованию Красной Армии.
В июне 1942 года штатная численность Управления особых отделов НКВД СССР составляла 225 человек.