Согласно рассказу балхского историка XVIII в. Юсуфа Мунши, низложенный хан обратился за военной помощью к потомку Бабура Великому Моголу Шах-Джахану (правил в Индии в 1627–1658 гг.). Но заподозрив Шах-Джахана в неблагожелательности, Надир-Мухаммад подался на запад и нашел приют у иранского шаха Аббаса II, и борьба продолжилась, но в конце концов победу одержал Абд ал-Азиз (
Все эти смуты значительно разорили страну и ослабили ханскую власть. Этими обстоятельствами воспользовались хорезмийские Шибаниды и несколько раз совершили грабительские набеги на территорию Бухарского ханства при Абу-л-Гази-хане и его сыне Ануша-хане. В частности, по словам хорезмийского историка Муниса, Абу-л-Гази-хан шесть раз водил войска в Бухару, дважды брал Кара-Куль, один раз — Кермине, один раз — Бухару и возвращался с бесчисленной добычей. «Дважды он встречался лицом к лицу с Абд ал-Азиз-ханом и в последний раз в битве нанес ему поражение» (МИКС, с. 453–454;
Престарелый и больной бухарский хан Абд ал-Азиз не сумел организовать ни надежной обороны, ни дать достойный отпор хорезмийцам. В стране копилось недовольство и все более возрастал авторитет его брата Субхан-Кули-султана. В такой обстановке Абд ал-Азиз счел целесообразным отречься от престола и направиться в
Со второй половины XVII в. в Бухарском ханстве наблюдается ослабление ханской власти и чрезвычайное усиление власти глав узбекских-дештских племен и родов. Правительственная власть все больше сосредоточивалась в Бухаре, а отдельные местности перешли во власть главарей отдельных узбекских родов, и главари этих кочевых родов из ханских наместников стали наследственными удельными хакимами. Так постепенно в Бухарском ханстве установилась та удельная система, которая была в Западном Туркестане в XIV в. до Тимура, когда распределение областей-уделов в стране происходило не между представителями правящего рода, а между главами сильных кочевых родов[178]. Эта удельная система была введена в Западном Туркестане Чагатаидом Кебек-ханом (1318–1326).
Главы узбекских родов и племен, представлявшие военную аристократию страны, с аталыком во главе, нередко пользовались представителями ханского рода Аштарханидов как орудием для достижения своих политических целей. Борьба с такими удельными правителями-биями заставила Надир-Мухаммада (1642–1645) уступить место своему наследнику, а воля Субхан-Кули-хана (1680–1702), который назначил своим преемником Мухаммад-Муким-султана, вообще не была выполнена, и эмиры, вопреки завещанию хана, возвели на престол Убайдулла-султана (1702–1711).
Убайдулла-хан был последним Аштарханидом, пытавшимся поставить предел своеволию главарей узбекских родов и усилить ханскую власть; поэтому все правление этого хана прошло в непрерывных войнах с главарями узбекских родов и племен — кунгратов, найманов, кенегесов, мангытов, хитай-кипчаков и т. п. В результате против Убайдуллы составился заговор, хан был схвачен и убит. На престол Бухары был возведен его брат Абу-л-Файз-султан (1711–1747), который стал игрушкой в руках военной аристократии. Центральная власть окончательно потеряла свое значение, управление страной почти полностью перешло в руки аталыка Мухаммад-Хаким-бия из племени мангыт. Ханство распалось на отдельные самостоятельные области.
Таким положением Бухары воспользовался завоеватель из Ирана Надир-шах (1736–1747), который в 1740 г. захватил Бухару и оттуда выступил в поход на Хорезм.
После превращения Бухары в вассальное владение персидского шаха вся государственная власть фактически была сосредоточена в руках ставленника Надир-шаха, аталыка Мухаммад-Хакима из племени мангыт, который на персидский манер принял титул
В 1747 г. Надир-шах был убит; в том же году по указанию Мухаммад-Рахима умертвили и Абу-л-Файз-хана. Всем в стране распоряжался Мухаммад-Рахим. В 1753 г., заручившись согласием знати и мусульманских авторитетов, аталык Мухаммад-Рахим вступил на бухарский трон с титулом эмира, а затем, женившись на дочери Абу-л-Файз-хана, объявил себя ханом в 1756 г.; он умер в 1759 г.
Его ближайший преемник Данияр-бек удовлетворился титулом аталыка, а ханский титул предоставил одному из потомков Чингиз-хана, Абу-л-Гази-султану, так что формально династия Аштарханидов продолжала существовать. Лишь его сын Шах-Мурад снова присвоил себе в 1785 г. все привилегии государя. Однако он и его преемники не принимали титул хана, а называли себя эмирами.
Так в 1785 г. закончилась история династии Джанидов (Аштарханидов), потомков Тукай-Тимура, сына Джучи, и началось правление новой династии в Бухаре — Мангытской (представителей отюреченного монгольского племени мангыт), свергнутой лишь в 1920 г.