В целом итоги операции «Гизела» принесли разочарование. Атаковать противника смогли только истребители первой «волны», – были сбиты 22 бомбардировщика, еще восемь получили тяжелые повреждения и разбились при посадке. Когда Ju88G6 начали атаки, экипажи бомбардировщиков получили приказ уходить на аэродромы в глубине Англии, и потому истребители «второй» и «третьей» волны уже просто не успели их перехватить. Потери же Люфтваффе составили 26 «Юнкерсов», из них 13 – из NJG. Часть самолетов была потеряна в ходе самой операции, а некоторые были списаны после аварийных посадок.
Вечером 7 марта 1945 г. около 1200 британских бомбардировщиков атаковало различные цели на территории Германии. Главными из них были Дессау и нефтеперерабатывающие заводы в районе Гамбурга и в городке Хеммингштедт, в 28 км севернее Брунсбюттеля. Англичане потеряли 41 бомбардировщик, при этом большинство самолетов сбили ночные истребители.
На счету Шнауфера были три «Ланкастера» из группы, бомбившей Дессау: два – в районе Дюссельдорф – Кассель, а третий – в районе Магдебурга. Он преодолел рубеж в 120 ночных побед, и, как потом оказалось, это был его последний успех в ходе войны.
Войска союзников продвигались вперед, и NJG4 покинула Гютерсло. 30 марта Шнауфер на Bf110G4 «3C+BA» в 02.29 перелетел на аэродром Вунсторф. Через несколько дней эскадра перебазировалась в Фассберг, в 74 км южнее Гамбурга, а затем 11 апреля – дальше на север Германии, на аэродром Эггебек, расположенный в 16 км северо-западнее г. Шлезвиг.
В этот период Шнауфер совершил несколько боевых вылетов, но все они оказались безуспешными. Так, в ночь на 9 апреля, когда британские бомбардировщики совершили налет на Киль, он поднялся в воздух, но так и не смог вступить в контакт с противником. 19 апреля в 23.10 Шнауфер снова поднялся в ночное небо, и опять никакого успеха. Единственными бомбардировщиками, действовавшими той ночью, были 122 «Москито», летавшие на недоступной для Bf110G высоте. Пробыв в воздухе 55 минут, пилот вернулся обратно в Эггебек. Свой же последний вылет Шнауфер совершил 21 апреля.
8 мая 1945 г. Третий рейх капитулировал, и командир NJG4 издал последний приказ. В нем, в частности, говорилось: