Для полетов на планерах мы использовали склоны Гютерфельде в районе Потсдама. Сначала мы выполняли короткие полеты на учебном планере SG38, который мы окрестили «осколком черепа». Среднее время, которое показал наш взвод во время первого полета, было двенадцать секунд, но Хейнц Шнауфер продержался в воздухе 18 или 19 секунд. С самого начала он был одаренным пилотом и всегда был впереди нас. Позже у нас появился спортивный самолет Klemm25, который поднимал в воздух двухместный планер Go4.
20 апреля 1939 г. в честь пятидесятого дня рождения Гитлера на оси «Восток – Запад» в Берлине был устроен большой парад. Специальные места рядом с магистралью были выделены для юнгманнов из NPEA Потсдама. Из-за высоких эсэсовцев, выстроившихся вдоль дороги, нам было не очень хорошо видно, и мы забрались на близлежащие деревья. Хейнц и я поднялись на самую верхушку дерева, оттуда у нас был великолепный обзор по сравнению с другими зрителями, включая многих иностранных военных атташе. Когда над нами пролетали самолеты, я увидел, как Хейнц зачарованно смотрит на них, как будто говоря: «Однажды и я буду в одном из них!» Так оно и случилось, он одним из первых был направлен в авиашколу. С этого момента я и Хейнц потеряли связь друг с другом. Из тридцати пяти юнгманнов летного взвода в Потсдаме лишь пятеро пережили войну».
Упомянутая выше ось «Восток – Запад» была частью плана по перестройке Берлина, составленного самим фюрером. Она представляла собой прямой проспект длиной около девяти километров. Он начинался от Унтерден-Линден, проходил под Бранденбургскими воротами и заканчивался на Адольф-Гитлерплатц.
15 ноября того же 39-го года Шнауфер прибыл в 42-й учебный авиаполк Люфтваффе, расквартированный в Зальцведеле. После прохождения курса начальной военной подготовки его направили в 3-ю авиашколу, находившуюся тогда в городке Губен, в 32 км северо-восточнее Котбуса. Там он выполнял учебные полеты на бипланах FW58, FW44 и Bu131. 20 августа 1940 г. Шнауфер получил сертификат «А/В», подтверждавший, что он прошел базовую летную подготовку и может пилотировать одномоторные самолеты.
После этого он прибыл в авиашколу С3, размещенную на аэродроме Альт-Лонневитц, в 63 км северо-восточнее Лейпцига. Там он прошел курс пилотирования многомоторных самолетов, освоив Do17, He111, Ju88 и Ju86, а также Ju52.
Фритц Энгау, ровесник Шнауфера, вспоминал о жизни в Альт-Лонневитце:
В апреле 1941 г. Шнауферу присвоили звание лейтенанта. Следующей ступенью обучения стали курсы «слепых» полетов в 5-й авиашколе, находившейся в Штаргарде (ныне Старгард-Щециньски, Польша). В течение восьми недель молодой пилот совершал вылеты на Do217 и Ju52, осваивая технику пилотирования исключительно по приборам.
Затем Шнауфер отправился во 2-ю авиашколу тяжелых истребителей. Он провел десять недель на аэродроме Вунсторф, где начал летать на Bf110. В Люфтваффе было обычной практикой, что экипажи самолетов формировались уже на завершающей стадии подготовки. Не сохранилось сведений, кто был первым бортрадистом-стрелком в экипаже Шнауфера, известно только лишь то, что его быстро заменили.