Вечером 6 ноября 235 «Ланкастеров» из 5-й бомбардировочной группы атаковали гидросооружения на канале Дортмунд – Эмс. Англичане потеряли десять бомбардировщиков, три из которых сбил Шнауфер. Теперь на его счету было 103 победы, и по числу ночных побед он обошел Лента, хотя все еще отставал от него по общему количеству одержанных побед. Румпельхардт указывал, что это никоим образом не было соревнованием и что Шнауфер совершенно не стремился стать лучшим из лучших.
В 1995 г. его адъютант Георг Фенглер вспоминал:
Вылет, который Шнауфер совершил вечером 6 ноября, стал его последним вылетом в IV./NJG1. Еще 26 октября его назначили командиром NJG4 вместо раненого оберст-лейтенанта Вольфганга Тиммига, и 14 ноября он официально занял эту должность. Шнауфер, которому до 23-летия оставалось около четырех месяцев, получил под начало четыре авиагруппы и штаб эскадры. Это была огромная ответственность для еще очень молодого человека.
Шнауфер хотел взять с собой адъютанта обер-лейтенанта Фенглера, но командир NJG1 Йоахим Ябс не разрешил этого, сказав при этом Шнауферу, что тот не может забрать с собой все опытные экипажи из IV./NJG1. Поэтому его адъютантом в NJG4 стал обер-лейтенант Эберхард Колтерманн, но дружба между Шнауфером и Фенглером сохранилась, и тогда еще никто и не мог даже предположить насколько в будущем их пути пересекутся.
Штаб NJG4 находился в Гютерсло. Это был полностью оборудованный аэродром, построенный Люфтваффе еще перед войной, где также базировалась и II./NJG4. Перед Шнауфером сразу же встала неожиданная проблема, так как его новая эскадра была оснащена более тяжелыми Ju88.
Румпельхардт вспоминал:
Шнауфер не только продолжил летать на старом Bf110G4, который использовал еще в IV./NJG1, но и сохранил его прежний бортовой код «G9+FE», а также свой радиопозывной «Орел 133». С одной стороны, это, возможно, действительно было суеверием со стороны Шнауфера, хотя, с другой стороны, многие асы Люфтваффе по различным причинам тоже сохраняли за собой индивидуальные радиопозывные. Кроме того, другие экипажи, участвовавшие в боевых вылетах, получали дополнительный стимул и уверенность, когда слышали радиопозывной «Орел 133».
Вечером 21 ноября Шнауфер совершил первый боевой вылет в составе NJG4. Тем вечером 1345 британских бомбардировщиков одновременно атаковали множество целей на территории Германии, среди которых были канал Дортмунд – Эмс, нефтеперерабатывающие заводы в Штеркраде и в Кастроп-Раукселе. Всего в ходе налетов англичане потеряли четырнадцать самолетов, включая два «Москито». При этом на счету Шнауфера были «Ланкастер» и «Галифакс», вероятно, из группы, совершившей налет на Штеркраде.
27 ноября Шнауфер на своем Ju88 прилетел в Берлин, где Гитлер вручил ему Бриллианты. Затем 1 декабря ему присвоили звание майора, и двадцатидвухлетний летчик стал на тот момент самым молодым офицером Люфтваффе в этом звании.
5 декабря Шнауферу пришлось пережить несколько очень тяжелых часов, когда практически у него на глазах был сбит Ju88, в чей экипаж входил его младший брат Манфред. Тот был призван на военную службу в 1943 г., Хейнц пообещал матери, что позаботится о восемнадцатилетнем брате. Манфред был переведен в Люфтваффе и направлен в школу бортрадистов в Эрфурте.