Поскольку на земле наступило очередное затишье, истребительные подразделения люфтваффе получили возможность уменьшить масштаб своих операций. В отдельные дни боевая деятельность стаффелей ограничивалось дежурством пар и четверок на аэродроме в 30-секундной готовности к взлету. Опасность подстерегала летчиков, главным образом, на земле — к бомбежкам и штурмовкам авиации союзников добавились рейды бойцов Спешиэл Эйр Сервиз. Отряды SAS совершали рейды в тыл немцев, одними из наиболее приоритетных задач этих групп являлись вывод из строя самолетов на стоянках и уничтожение жизненно важных для работы авиации резервуаров с горючим.
В ответ на новые угрозы, в Мартубе был организован центр управления действиями истребителей-перехватчиков. Помещения центра в целях обеспечения безопасности разместили в подземных убежищах. Маршруты полета самолетов противника, вероятные пути движения групп SAS наносились на прозрачную кальку, которая накладывалась на крупномасштабную топографическую карту. Наглядное изображение повышало эффективность управления действиями своих истребителей. Люфтваффе и Реджиа Аэронаутика тесно взаимодействовали друг с другом на протяжении всей кампании в Африке, тем не менее, итальянцы имели свою службу наблюдения и оповещения, к которой был прикомандирован немецкий офицер связи.
Германские истребители-бомбардировщики в ходе сражения за Крит продемонстрировали каких успехов они способны добиться. В 27-й эскадре выделялся специальный дежурный стаффель, предназначенный для поддержки наземных войск и готовый взлететь немедленно по получению соответствующего приказа. Удары наносили и более мелкие, чем стаффель, группы, стараясь держать противника в постоянном напряжении. В ходе подобной войны на истощение были уничтожены или получили повреждения многие самолеты противника.