Подпунктом 9 п. 3 ст. 149 НК РФ (в редакции, действовавшей до вступления в силу Закона № 85-ФЗ) было установлено, что не подлежали обложению НДС (освобождались от налогообложения) на территории Российской Федерации операции по реализации драгоценных металлов в слитках Банком России и банками при условии, что эти слитки оставались в одном из сертифицированных хранилищ (Государственном хранилище ценностей, хранилище Банка России или хранилищах банков).
В соответствии со ст. 143 НК РФ плательщиками НДС признаются в том числе организации, к числу которых согласно п. 2 ст. 11 настоящего Кодекса относятся банки.
Минфин России в данном письме отметил, что действовавшими нормативными правовыми актами было установлено, что операции с драгоценными металлами могли совершаться банками, которые имели лицензии Банка России на осуществление операций с драгоценными металлами, а также Банком России, осуществлявшим деятельность на основании Федерального закона от 10.07.2002 № 86-ФЗ «О Центральном банке Российской Федерации (Банке России)».
На основании вышеуказанных норм подпункта 9 п. 3 ст. 149 НК РФ Минфин России пришел к выводу, что при реализации банками слитков драгоценных металлов обязанность по уплате НДС возникала при изъятии слитков из хранилищ, за исключением операций по реализации слитков в процессе межбанковского оборота, когда и продавцами, и покупателями являлись банки, которые имели лицензии Банка России на осуществление операций с драгоценными металлами, а также Банк России.
В письме Минфина России от 20.10.2005 № 03-04-03/09 указано, что операции по реализации слитков драгоценных металлов, осуществлявшиеся банком и отражавшиеся по обезличенным металлическим счетам клиентов (физических лиц) без изъятия драгоценных металлов из сертифицированного хранилища банка-продавца, обложению НДС не подлежали. В случае изъятия драгоценных металлов из соответствующего хранилища банка-продавца, включая изъятие драгоценных металлов, стоимость которых была ранее зачислена на обезличенный металлический счет клиента, такие операции подлежали обложению НДС.
Таким образом, с момента вступления в силу Закона № 85-ФЗ в силу прямого указания закона операции по реализации драгоценных металлов в слитках организации, не являющейся банком, освобождаются от обложения НДС при условии, что эти слитки помещены в одном из хранилищ, указанных в подпункте 9 п. 3 ст. 149 НК РФ.