Избрав новым генералом капитана Шарпа, флибустьеры снова собрались на острове Койба на совещание: решался вопрос, вернуться ли через Панамский перешеек в Карибское море или отправиться в крейсерство к берегам Южной Америки с последующим возвращением в Вест-Индию через Магелланов пролив. Примерно 60 человек высказались за немедленное возвращение и, забрав одну барку, вскоре ушли. Остальные 146 человек во главе с капитаном Шарпом и Эдмундом Куком решили идти к побережью Эквадора.
В середине сентября флибустьеры перехватили корабль, шедший из Гуаякиля в Кальяо, а затем продолжили путь на юг вдоль перуанского побережья. В начале ноября они высадились на подступах к маленькому портовому городку Ило, но, увидев на пляже испанский отряд из 300 человек, отказались от нападения. Освободив часть пленных, Шарп во главе 35 пиратов в декабре 1680 года совершил набег на поселок Ла-Серену близ Кокимбо.
В конце декабря флибустьеры прибыли на острова Хуан-Фернандес. Здесь 16 января 1681 года они отстранили его от командования и избрали новым генералом Джона Уотлинга. На следующее утро флибустьеров ожидал неприятный сюрприз: в открытом море показались 3 испанских военных корабля. Они шли прямо к острову. Капитан Уотлинг велел спешно готовиться к отплытию. Но когда пираты поднялись на борт «Тринити», обнаружилось, что пропал индеец Уиль. Последний охотился в долине на диких коз, не подозревая о случившемся. Лишь вернувшись на берег, он понял, что его покинули.
Отправившись к побережью Перу, пираты решили атаковать Арику. Дело, однако, обернулось катастрофой. 9 февраля, во время штурма испанских укреплений, около 30 англичан было убито, включая капитана Уотлинга, а 9 человек угодили в плен. Выжившие, отстреливаясь, вернулись на борт «Тринити» и вновь избрали генералом Шарпа. В конце марта он сделал высадку в Гуаско – береговом поселке, жители которого бежали в горы. 6 апреля, уже во второй раз, они напали на городок Ило, захватив его перед самым рассветом. 27 го числа того же месяца, когда пираты находились на пути от острова Ла-Плата, 44 из них отказались продолжать поход под командованием Шарпа. Среди недовольных оказались Уильям Дампир и Лайонел Уофер. На баркалоне и лодке они отправились в Панамский залив.
Что касается Шарпа, то он взял курс на залив Никоя, куда и прибыл во второй половине мая. В этом месте, а затем в заливе Дульсе он сделал несколько высадок, которые принесли пиратам только продовольствие и пленных. Наконец, решив со своими людьми возвращаться к берегам Перу, он оставил залив Дульсе. 20 июля флибустьеры захватили корабль «Сан-Педро», шедший из Кальяо в Панаму и перевозивший более 37 тыс. пиастров.
8 августа на широте мыса Пасадо Шарп погнался за вооруженным торговым кораблем «Сан-Росарио»; он направлялся из Кальяо с 24 пассажирами и грузом вина, бренди, оловяных слитков и артишоков. Позже моряк Симон Кальдерон показал под присягой, что «пираты настигли его, а затем начали стрелять из мушкетов и первыми же тремя выстрелами убили капитана “Росарио”, Хуана Лопеса, и стреляли вновь, и захватили корабль, и взяли с него все, что они посчитали необходимым из вина и бренди, а также все серебро и другие вещи, имевшие ценность, и замучили двух испанцев с целью узнать, не было ли у них еще серебра, и порезали паруса и такелаж, кроме грот-паруса, и пустили корабль по воле ветра вместе с людьми…». Но, пожалуй, самым ценным призом, взятым на борту «Сан-Росарио», оказались секретные навигационные карты Южного моря.
После неудачного нападения на Пайту (сентябрь 1681 года) пираты решили вернуться в Вест-Индию. 1 декабря 1681 года они обогнули мыс Горн, а в феврале 1682 года прибыли к Барбадосу. Поскольку в гавани Бриджтауна находился военный корабль «Ричмонд», флибустьеры не отважились войти туда и направились к острову Антигуа. 10-го числа того же месяца «Тринити» стал на якорь у Антигуа, однако местный губернатор отказал им в стоянке. Оставив «Тринити» тем из своих товарищей, которые проиграли свою долю добычи в кости, около 20 других на 2 торговых судах решили идти в Англию; капитан Шарп был в их числе.
Шарп прибыл в Плимут в апреле. Менее чем через три месяца он предстал перед Верховным судом Адмиралтейства вместе со своими дружками. Их обвиняли в пиратстве и убийствах. Главным обвинителем был посол Испании в Лондоне дон Педро Ронкильо. Однако Шарп и двое других обвиняемых были оправданы из-за «нехватки доказательств», потому что суд отказался рассматривать свидетельские показания двух молодых индейцев.
Шарпа и его людей спасли от виселицы навигационные карты Южного моря, которые они взяли на «Сан-Росарио». За несколько дней до процесса, когда суд еще не вынес своего приговора, король Карл II, получивший копию с этих карт, понял их ценность и просил судей сначала отсрочить судебное разбирательство, а потом вынести обвиняемым оправдательный приговор.