К кладке самка приступает довольно рано, и в большинстве районов Советского Союза, как правило, уже в первой декаде апреля идет интенсивное насиживание. В благоприятные по кормовому режиму годы птицы начинают размножение раньше, в голодные — позже. Обычно кладка содержит 2—3, реже 3—4, а иногда и 5 яиц. Яйца округлые, белые, с характерной грубозернистой, шероховатой скорлупой, которая по мере насиживания становится более гладкой. Размеры яиц у разных подвидов и даже в одной кладке заметно варьируют. Так, у сибирских птиц яйца нередко достигают 59x50 миллиметров. Средний же размер яиц филинов в Европе 57x45 миллиметров.
Насиживает кладку самка. На это у нее уходит 33—35 суток. Яйца филин несет со значительными перерывами, судя по тому, что птенцы порой вылупляются с интервалами в трое-четверо и даже более суток. Вес однодневных птенцов обычно не превышает 60—63 граммов.
Из-за разницы в сроках вылупления очень заметны и различия в росте и развитии птенцов, особенно в течение первого месяца. Старший птенец может быть почти в пять раз тяжелее младшего. Так, О. В. Егоров и Ю. В. Лабутин в Якутии нашли в одном гнезде птенцов, весящих 130 и 640 граммов. К моменту же вылета из гнезда эти филинята оказались примерно одинаковыми (1830 и 1850 граммов), а позднее, в неволе, младший птенец обогнал по весу старшего.
В гнезде филинята пребывают около месяца, после чего, не умея еще летать, разбредаются поодиночке и при возможности перебираются с земли на ветки деревьев. К этому времени из белых пуховых комочков они превращаются в лохматых и длинноногих недорослей, одетых в неопределенного цвета, на вид грязноватый промежуточный наряд из пуховидных перьев, сквозь который во многих местах уже начинает пробиваться юношеское перо. Интересно, что у филинят, как и у птенцов совок, промежуточный наряд часто тоже поперечнополосатый. В двухмесячном возрасте птенцы уже в состоянии перепархивать, а в трехмесячном они хорошо летают.
Имеются данные, что с подъемом на крыло птенцов выводок филина якобы распадается и молодые птицы приступают к самостоятельной жизни. Однако нам это кажется маловероятным. Трехмесячные филинята выглядят еще довольно беспомощными и невозможно предположить, что они уже могут прокормить себя.
Питание филина привлекало внимание с давних пор, ибо человек привык рассматривать филина как конкурента в использовании ресурсов природы. Вопрос: «Вредная ли птица филин?» — ставился стократно. Предвзятое отношение к этой сове особенно было заметно в старое время. Так, Э. А. Эверсман, характеризуя трофические связи филина, указывал в 1866 году, что питается он зайцами, разными грызунами, молодыми северными оленями и дикими козами. А. А. Силантьев и Н. А. Холодковский в монументальной книге «Птицы России», вышедшей в 1901 году, отмечали, что жертвами филина являются зайцы, кролики, глухари, тетерева, рябчики, куропатки, утки, гуси, дневные хищные птицы, вороны, совы; мыши и крысы — любимая пища; поедает филин даже ежей. Примечательно, что перечень начат не с наиболее обычной для филина добычи — мышей и крыс, а с видов, представляющих определенный интерес для людей. С узкоутилитарных позиций оценивалось значение филина и позже. Даже в руководстве «Полезные в сельском хозяйстве птицы и защита их», выпущенном в 1932 году, право филина на существование ставилось под сомнение. А спустя два года П. Б. Юргенсон в книге «Биологические основы дичеразведения» отнес филина к «безусловно вредным» птицам.
Сейчас это может показаться странным, но долгое время почему-то игнорировалось, что животное, столь широко распространенное, как филин, если даже и приносит вред в какой-то местности, то в другом районе может быть не только безвредным или терпимым, но даже весьма полезным. На необходимость помнить об этом указывал еще А. Н. Формозов. Поэтому, чтобы выносить окончательный приговор любому животному, надо знать численное соотношение жертвы и хищника, а также изучить роль хищника как фактора естественного отбора. Последствия легкомысленной оценки роли филина сегодня достаточно очевидны. Там, где это оказалось возможным, филина уничтожили. Выжил он по существу лишь в местах, особенно мало посещаемых людьми.
Что же мы знаем сегодня о питании филина там, где он еще сохранился? Филин, действительно, в состоянии добывать млекопитающих и птиц размером с зайца и глухаря. Он промышляет также различных пресмыкающихся, земноводных и даже рыбу. Правда, последняя в его когти попадает нечасто и, по данным В. П. Теплова, например, в Печоро-Илычском заповеднике рыба составляет в его пище всего 0,4 процента. О том, что филин изредка кормится рыбой в степной зоне, сообщает Л. А. Портенко. И известно лишь, что в верховьях Лены, на перекатах Пеледуя, филины выхватывают ленков из воды более или менее систематически.