18 (30) ноября 1814 г. «Суворов» пришел в Ново-Архангельск. В следующем году «Суворов» ходил за пушниной к островам Св. Павла и Св. Георгия (острова Прибылова), в мае вернулся в Ново-Архангельск и 23 июля (4 августа) вышел оттуда с грузом пушнины и товаров, предназначенных для продаже в Лиме (Перу). Судно заходило в Сан-Франциско для приобретения продуктов и приема запасов пресной воды. На пути от Сан-Франциско до Кальяо (порт Лимы) Лазарев останавливался у о. Сокорро (архипелаг Ревилья-Хихедо) и, сойдя на несколько часов на берег, определил по лунным расстояниям его координаты.
Следуя далее на юг, Лазарев у о. Кокос проверил хронометры, затем зашел в селение Санта-Роса. 25 ноября (7 декабря) «Суворов» пришел в Кальяо и простоял там, ожидая окончания торговых операций до 14 (26) февраля 1816 г. Во время стоянки по многим лунным расстояниям была определена долгота этого порта. В Кальяо Лазарев взял с собой подаренное русскому императору местными властями собрание перуанских древностей.
Выйдя из Кальяо, Лазарев направился на юг к мысу Горн и вышел в Атлантику. Посетив о. Фернандо-Норонья, Портсмут и Хельсингёр (Дания), судно 15 (27) июля возвратилось в Кронштадт. Лазарев привез из Кальяо в Россию много диковинных предметов, а также еще невиданных тогда в Европе лам, альпаку и вигонь. Благодаря заботливому уходу моряков за этими животными они благополучно перенесли длительное и довольно тяжелое морское путешествие. В ходе путешествия продолжительностью 2 года 9 Ѕмесяцев самый длительный переход под парусами от Рио-де-Жанейро до Порт-Джексона продолжался 112 дней. Лазарев, командуя судном «Суворов», показал себя не только как искусный и решительный морской офицер с большими организаторскими способностями, но и как смелый исследователь.
Ф.Ф. Беллинсгаузен был назначен на должность начальника антарктической экспедиции лишь незадолго до ухода в плавание, поэтому оборудование шлюпов, подготовка снаряжения и комплектование команд легли на М.П. Лазарева. Он сумел набрать экипажи из моряков, пожелавших добровольно отправиться в длительную экспедицию.
Экипаж «Востока» состоял из 117 моряков. Старшим офицером шлюпа был назначен капитан-лейтенант И.И. Завадовский, вахтенными начальниками определили лейтенантов И.Ф. Игнатьева, К.П. Торсона, А.С. Лескова, мичмана Д.А. Демидова, штурманом шлюпа назначили Я. Парядина. Кроме того, в экспедиции приняли участие астроном И.М. Симонов, академик живописи Петербургской Академии художеств П.Н. Михайлов, штаб-лекарь Я. Берг.
Экипаж «Мирного» состоял из 73 моряков. Из офицеров на нем, кроме М.П. Лазарева, были лейтенанты Н.В. Обернибесов, М.Д. Анненков, мичманы И.А. Куприянов, П.М. Новосильский, а также медик-хирург Н.А. Галкин и штурман Н. Ильин.
Наиболее опытными офицерами экспедиции считались капитан-лейтенант Иван Иванович Завадовский и лейтенант Константин Петрович Торсон. Беллинсгаузен очень ценил Заводовского, которого знал по совместной службе на Черном море и с которым был дружен. По возрасту Завадовский был старше своего начальника и всех офицеров экспедиции. Он плавал на кораблях эскадр, которые возглавляли адмиралы Ушаков и Сенявин, принимал участие в боевых действиях русского флота в Восточном Средиземноморье и Черном море. Завадовского уважали за его решительность, смелость и опыт.
Уважением и авторитетом пользовался и лейтенант Торсон. По свидетельству современников, Торсон был зачислен в экспедицию «по хорошему отзыву известных морских капитанов» и являлся «одним из самых отличных и ученых флотских офицеров и самых кротких людей». Но, безусловно, этот «кроткий» офицер был решительным и мужественным человеком. В Отечественную войну 1812 г. Торсон, служивший мичманом на фрегате «Амфитрида», первым из русских военных моряков получил боевое отличие – орден Св. Анны 3‑го класса.
В Копенгагене к экспедиции должны были присоединиться два натуралиста-немца, но они в последнюю минуту отказались. Замены им уже не нашли. Беллинсгаузен писал по этому поводу: «В продолжение всего путешествия мы всегда сожалели и теперь сожалеем, что не было позволено идти с нами двум студентам по части естественной истории из русских, которые того желали, а предпочтены им неизвестные иностранцы» [25, с. 189].
Оба экспедиционных шлюпа «Восток» и «Мирный» были построены на отечественных верфях почти одновременно, в 1818 г. «Восток» имел водоизмещение 900 тонн, длину 30, 5 м и ширину 10 м, 28 пушек. Его построил на Охтенской верфи англичанин – корабельный инженер этой верфи Стоке. Как выяснилось позже, рангоут шлюпа оказался излишне высок, а корпус явно был недостаточно прочен для плавания во льдах. Правда, уже в Кронштадте перед самым уходом экспедиции корабельный мастер Амосов по мере возможности укрепил подводную часть корпуса «Востока» и обшил ее снаружи медными листами.