Вирус, который сломал планету. Почему SARS-CoV-2 такой особенный и что нам с ним делать

В нескольких работах было показано, что концентрация вирусной РНК в слюне не так сильно зависит от времени проведения теста[321],[322], так что ее анализ может стать хорошей альтернативой стандартному тестированию образцов из глотки (заодно это здорово облегчит проведение тестов у детей, которым категорически не нравится процедура взятия мазка из глотки). Возможно, в будущем такие тесты станут нормой в массовой практике, пока же все еще используется стандартный протокол. И причина не в том, что ученые как-то особенно упрямы или не читают статей коллег. Просто для валидации тест-системы, в которой в качестве образца используется слюна, потребуется вновь проходить множество долгих процедур, а в условиях, когда каждый день нужно было проводить тысячи тестов, никто к этому не был готов. Летом, когда ученые и медики немного освоились с коронавирусной инфекцией, работа над новыми протоколами интенсифицировалась. Впрочем, у некоторых из существующих, но не валидированных тест-систем, которые используют слюну, есть еще один недостаток: они требуют довольно большого количества исходного материала — около 10 миллилитров, причем в идеале собирать образцы рекомендуется с утра, не ев, не пив и не чистив зубы[323]. Набрать такое количество слюны довольно затруднительно даже взрослым, для детей эта задача и вовсе может оказаться непосильной. Кроме того, густая — ведь человек не пил — слюна плохо пипетируется, что может повлиять на качество результата[324].

Тоже материал

Теоретически в качестве образца для анализа на наличие вирусной РНК можно использовать кал — мы уже обсуждали, что SARS-CoV-2 может размножаться в кишечнике и выделяться с экскрементами. Но, во-первых, неясно, у всех ли зараженных это происходит, во-вторых, мы не знаем, какова динамика выделения вируса в зависимости от стадии болезни, и, в-третьих, содержащиеся в кале вещества могут мешать прохождению ПЦР[325].

Тест на антитела

Если РНК-тест выявляет активную стадию болезни, то серологический, он же тест на антитела, показывает, перенес ли человек COVID-19 в прошлом — хотя иногда может выявлять и текущую инфекцию. Как мы неоднократно обсуждали в предыдущих главах, когда в нас проникает патоген, организм мобилизует для защиты от него иммунную систему. Если повезет, она задавит врага силами врожденного иммунитета, которые неспецифично убивают самых разных «вторженцев». И только когда это не поможет, начинает раскручиваться махина адаптивного иммунитета, настраивающегося конкретно на этого паразита. Важнейшими игроками этой системы являются антитела — белковые молекулы, которые накрепко прилипают к какому-нибудь месту на поверхности патогена, маркируя его для клеток-пожирателей вроде макрофагов.

Первыми появляются антитела типа М^{55} — они связываются с врагом не очень прочно и не слишком специфично. Иммуноглобулины типа G подтягиваются позже, так как им требуется время, чтобы «созреть»: благодаря хитрому процессу локальных мутаций в производящих эти антитела B-лимфоцитах каждое следующее поколение IgG прочнее прикрепляется к антигену (подробнее см. в главе «Что коронавирус делает с нами»). Однако в случае коронавируса разница в появлении IgM и IgG не слишком велика: оба типа антител начинают обнаруживаться в крови к концу первой недели после появления первых признаков COVID-19[326]. Но на этом этапе концентрация иммуноглобулинов слишком мала: стандартные массовые тесты стабильно определяют оба типа антител начиная с 14-го — 21-го дня[327]. Концентрация IgG и IgM увеличивается со временем (хотя и с разной скоростью) и выходит на плато примерно на 17-й –19-й день после появления симптомов[328].