В середине сентября 1943 г. испытания «Омеги» были приостановлены: институт возвращался из эвакуации в Москву. В столице И.П. Братухин восстанавливает ОКБ- 3 и опытную машину, но в условиях учебного заведения перспективы развития отечественного вертолетостроения оставались ограниченными. Это понимали не только конструкторы. К этому времени вертолетостроение в промышленно развитых странах достигло заметных успехов. В вооруженных силах США, Великобритании и Германии появились первые вертолеты. Их военное применение подтвердило большие перспективы винтокрылых летательных аппаратов.
К началу 1944 г. ВВС Красной Армии были уже хорошо оснащены боевой техникой традиционных для того времени образцов. Поэтому командование ВВС и руководство авиационной промышленности СССР смогли обратить внимание и на освоение принципиально новых видов авиационной техники. Руководство Наркомата авиационной промышленности решило принять ОКБ-3 в свою систему и разместить его на «Территории №2» бывшей мебельной фабрики между 2-й и 3-й Рыбинскими улицами Москвы.
11 января 1944 года Нарком А.И. Шахурин отдал приказ №9c, который гласил:
Так ОКБ-3 обрело свое постоянное место, на котором впоследствии обосновался Московский вертолетный завод.
Следующая разработка ОКБ И.П. Братухина – «Омега-II» стала первым винтокрылым летательным аппаратом, собранным на территории нынешнего МВЗ. Вертолет создавался на базе первой «Омеги», но многие ответственные части конструкции пришлось делать заново.
Сотрудники ОКБ-3 вместе со специалистами других предприятий заменили ненадежные лицензионные моторы МВ-6 на отечественные двигатели МГ-31-Ф, изготовили новые подмоторные рамы, полностью переделали систему принудительного охлаждения силовой установки, масло- и бензобаки, топливную систему и капоты мотогондол. Частичному изменению также подверглись редукторы трансмиссии, муфты включения и фермы боковых консолей.
15 сентября 1944 года вертолет «Омега- II» был передан на заводские испытания. Он представлял собой двухместный двухмоторный вертолет двухвинтовой поперечной схемы с относительно высоко нагруженными несущими винтами и предназначался для использования в качестве артиллерийского корректировщика и связного летательного аппарата. Винтомоторные группы находились в мотогондолах по концам боковых ферменных консолей, под которыми подвешивался фюзеляж. Винтокрылые летательные аппараты подобной схемы и компоновки в то время никем в мире не разрабатывались. Вертолеты конструкции И.П. Братухина были абсолютно оригинальны.
Мотогондола включала в себя ряд агрегатов. Основным ее силовым элементом являлся кабан, к которому крепились моторама с двигателем, нижний редуктор с вентилятором, верхний редуктор с несущим винтом, маслобак и стойка шасси с колесом. Все агрегаты были закрыты обтекаемым капотом круглого сечения. Сверху кабана мотогондолы крепился трехлопастной несущий винт диаметром 7 м.