В соответствии с предложением В.А. Малышева с 1 января 1947 г. Отдел главного конструктора по тяжелым танкам на ЛКЗ и ОКБ при филиале завода №100 слили в один Отдел главного конструктора при филиале завода №100. При этом Отдел главного конструктора по тяжелым танкам на ЛКЗ был упразднен. Следующим шагом стало создание на базе ленинградского филиала завода №100 (на территории ЛКЗ) Всесоюзного научно-исследовательского танкового и дизельного института №100 (ВНИИ-100) Министерства транспортного машиностроения СССР. Постановление Совета Министров СССР №2026-795 о его организации было подписано 11 июня 1948 г. (приказ Министерства транспортного машиностроения №180 от 16 июня 1948 г.).
9 марта 1949 г. Совет Министров СССР утвердил первоочередные мероприятия по обеспечению работы ВНИИ-100. Руководству Министерства транспортного машиностроения и института вменялось в обязанность наряду с НИР проводить и ОКР, а также в кооперации с цехами ЛКЗ изготавливать опытные образцы по своим проектам. Уже 19 марта того же года заместитель председателя Совета Министров СССР В.А. Малышев своим приказом установил подчиненность института 1 Главному управлению Министерства, назначив директором института Ж.Я. Котина с сохранением за ним должности главного конструктора ЛКЗ.
4 июня 1949 г. вышел приказ №1 директора о начале деятельности ВНИИ-100. В соответствии с утвержденной схемой управления институт располагал пятью конструкторскими, десятью научно-исследовательскими и общеинститутскими отделами, опытной производственной базой (механический, инструментальный и сборочный цеха), вспомогательными службами и танкоиспытательной станцией. Первоначальный кадровый состав ВНИИ-100 насчитывал 1010 человек.
До середины 1951 г. ВНИИ-100 выполнял двоякую функцию – как отраслевого, так и заводского уровня. Однако ОКР превалировали над научно-исследовательской тематикой. Интересы ЛКЗ ставились выше отраслевых. В соответствии с распоряжением Совета Министров СССР №13081 рс от 31 июля 1951 г. на ЛКЗ было организовано Особое конструкторское бюро по тяжелым танкам (ОКБТ) с опытно-экспериментальной базой. В состав ОКБТ помимо сотрудников ЛКЗ вошли инженерно-технические работники, служащие и рабочие (в необходимом количестве), переведенные из ВНИИ-100 в соответствии с приказом Министерства транспортного машиностроения №535 от 10 августа 1951 г. Начальником ОКБТ и главным конструктором завода был назначен Ж.Я. Котин. С его переходом на ЛКЗ директором ВНИИ-100 стал П.К. Ворошилов, а заместителем директора по НИР – В.Т. Ломоносов
Одновременно ЧКЗ распоряжением Совета Министров СССР №13605рс от 4 августа 1951 г. в качестве опытно-экспериментальной базы был передан Опытный завод №100. Конструкторским бюро на ЧКЗ (ЧТЗ) последовательно руководили Н.Л. Духов, М.Ф. Балжи и П.П. Исаков.
Активное участие в создании тяжелых танков и научном сопровождении НИОКР по ним принимали сотрудники НТК ГБТУ (УНТВ), Академии бронетанковых войск им. В.И. Сталина и НИИБТ полигона.
Необходимо отметить, что ряд НИОКР, связанных с повышением боевых и технических характеристик послевоенных тяжелых танков, был выполнен с использованием ИС-2 и ИС-3 военного года выпуска и после проведения мероприятий по УКН.
Так, например, еще в 1946 г. на полигоне Ленинградской высшей офицерской бронетанковой школы (ЛВОБШ) им. Молотова в период с 20 августа по 5 сентября прошли испытания двух трофейных немецких танковых дальномеров: стереоскопического горизонтальнобазного (база 1600 мм) и моноскопического вертикальнобазного типа «Конциденц» (база 1000 мм), установленных на танках ИС-2 и ИС-3, по программе Арткома ГАУ ВС и НТК ГБТУ ВС