Наконец Жиль де Рэ был задержан и ознакомлен с обвинительным документом, но имел смелость отрицать все обвинения. Он признался лишь в чтении одной-единственной книги по алхимии, уточнив, что получил ее от некоего шевалье из Анжу, ныне обвиняемого в ереси. Мужественный маршал предложил судьям прибегнуть к ордалии — испытанию каленым железом, иначе именуемому «божьим судом». Как любой человек знатного происхождения, он желал воспользоваться этой привилегией и доказать свою невиновность таким образом. Но суд отклонил просьбу, больше того, было решено подвергнуть барона де Рэ пытке, чтобы прекратить запирательства, вместе с четырьмя предполагаемыми сообщниками.
Обвинения в многочисленных убийствах и предваряющих их пытках были предъявлены де Рэ светским судом, но тут маршал сменил тактику и заявил о собственной неподсудности местному светскому суду. Действительно, духовный суд мог судить его только за преступления, направленные против авторитета и прав Церкви, — Жиль все еще мог отказаться от признательных показаний, данных под пыткой; а за преступления уголовные, подлежащие суду светскому, Жиля де Рэ как пэра и маршала Франции мог судить исключительно король. В случае вмешательства короля прославленному герою Франции, несмотря на чудовищное обвинение в убийстве и расчленении более 800 крестьянских детей и почти 200 женщин, грозила лишь суровая епитимья и денежный штраф за оскорбления, нанесенные Церкви в лице ее служителя.
Протест маршала был отвергнут — благодаря признаниям Прелатти и нескольких слуг барона, доказывающих обвинения в ереси и колдовстве, то есть преступлениях, находящихся в ведении инквизиции, суду которой были тогда подсудны абсолютно все, невзирая на сословные различия.
Суд состоялся и приговорил строптивого маршала к смерти через повешение с последующим сожжением трупа. Жиль де Рэ был казнен 26 октября 1440 года. Его судьбу разделили двое слуг, неохотно свидетельствовавших против своего господина.
Свидетель казни:из протокола казни Жиля де Рэ и его преданных слуг — Пату и Анриэ, засвидетельствованного подписью Тушранда:
Годы проходили и складывались в столетия, о маршале Жиле были сложены баллады и сказки, в которых обладатель русых волос превратился в зловещего колдуна и погубителя юных жен по прозвищу Синяя Борода. Позже барон — мистик и черный романтик — стал непременным персонажем готических романов — Артур Мейчен, Роберт Блох, В.И. Кржижановская-Рочестер, Д.К. Гюисманс и другие посвятили ему страницы полные тайны, мрачного очарования и темного, запретного эротизма.