Внутри «Черных пантер» ФБР с помощью искусно проведенной интриги вызвало острый конфликт между группами сторонников двух руководителей – Э. Клевера и X. Ньютона. Результатом этой провокации также стала гибель ряда активистов организации.
Благодаря этим мерам только за первые 18 месяцев в ходе «Коинтелпро» было убито 28 руководителей и видных активистов «Черных пантер», другие оказались за тюремной решеткой или были вынуждены бежать за пределы США.
Наряду с этим ФБР часто практиковало и менее суровые меры – так называемые «беспокоящие аресты» членов «Черных пантер» под вымышленными предлогами подозрений в уголовных преступлениях. В масштабах страны такие аресты проводились сотнями, причем в каждом отдельном случае «основания» варьировались от обвинений в убийствах, поджогах, сбыте наркотиков, разбое, мятеже до кражи автомобилей, укрывательства краденого и обширного комплекса нарушений правил дорожного движения.
В результате всех этих провокаций ФБР удалось в короткий срок разгромить «Черных пантер», причем не с помощью правосудия, а в основном путем «активных мероприятий». При этом у неискушенной общественности создалось впечатление, что эта организация умерла, так сказать, естественным путем, по причине внутренних разногласий, расколов и дрязг между лидерами, как это часто происходит с экстремистскими группами. Те, кто был более осведомлен, подозревали, что дело не обошлось без ФБР. Когда же в 1976–1977 гг. часть из материалов «Коинтелпро» была обнародована, выяснилось, что факт ликвидации «Черных пантер» как общенациональной организации ФБР практически ставит в заслугу только себе. В документе ФБР, датированном 4 марта 1971 г., говорилось об этом в тоне победной реляции: «Анализ показывает, что хаотическое внутреннее положение в партии «Черные пантеры» и раскол среди ее лидеров … являются, по всей видимости, прямым результатом наших интенсивных контрразведывательных усилий …».
Помимо «Черных пантер» ФБР уделяло внимание и более умеренным негритянским организациям различной политической ориентации, таким, как «Союз черных студентов», «Студенческий координационный комитет ненасильственных действий», «Южная конференция христианского руководства» и др.
Среди негритянских общественных деятелей одной из «приоритетных» мишеней ФБР был известный борец за гражданские права Мартин Лютер Кинг. Официальная версия ФБР гласит, что прослушивание всех телефонных разговоров Кинга началось осенью 1963 г. с санкции министра юстиции Р. Кеннеди. Фактически все началось значительно раньше.
Для травли Кинга использовался широкий и разнообразный набор методов: его телефонные разговоры прослушивались и записывались; в гостиницах, где ему приходилось останавливаться, устраивались провокации; соратникам Кинга систематически подбрасывали разного рода ложные сведения, порочащие негритянского лидера; в ходе его выступлений с целью вызвать панику среди слушателей имитировались сигналы тревоги; банкеты в его честь по настоянию ФБР подвергались бойкотам. Существует также версия, озвученная на русском языке в книге Джона Бэррона «Операция «Соло"», согласно которой ФБР пыталось скомпрометировать Кинга, используя полученные при помощи прослушивания сведения о его беспорядочных половых связях.
В том же 1968 году действие программы «Коинтелпро» было распространено на так называемых «новых левых» – антисистемное леворадикальное студенческое движение, возникшее на почве протестов против войны во Вьетнаме. В секретном меморандуме штаб-квартиры ФБР от 9 мая 1968 года, направленном во все региональные офисы, об этом было сказано следующее: