Отвечало за обучение сотрудников Мухабарат. Ее офис располагался в районе Джихад (возможно, в Абу-Грейб в западном пригороде Багдада), с полноценными жилыми помещениями и супермаркетом. Выпускники средней школы проходили трехлетний курс обучения, а выпускники колледжей - 18 месяцев, прежде чем поступить в разведку в качестве младших офицеров.
Офис планирования
Отвечал за сбор и анализ информации со всего мира, включая открытые источники, такие как радио, спутниковое телевидение и газеты.
Офис пропаганды
Отвечал за проведение операций психологической войны, в том числе за распространение дезинформации.
Специальное бюро
Управление 5 - Контрразведка
Отвечало за обнаружение и нейтрализацию агентов внешней разведки, уделяя особое внимание сирийским агентам. Управление 5 работало совместно с Управлениями 3, 4, 14 и 18.
Управление 6 - Безопасность Мухабарата
Отвечало за поведение офицеров и других членов Мухабарата. Управление 6 отвечало также за выдачу документов, паспортов и брачных договоров для всех сотрудников Мухабарата.
Управление 7 - Аль-Хакимия
Основным центром допросов Мухабарата было Аль-Хакимия, которая располагалась напротив офиса паспортов на 52-й улице.
Управление 19 - Надзор за персоналом
Отвечал за слежку за сотрудниками Мухабарата.
Управление 22 - Охрана
Отвечало за личную защиту старших должностных лиц Мухабарата и высокопоставленных гостей.
Офис 16
Проводил обучение агентов по ведению тайных операции за рубежом.
Бригада Мухабарата
Силы быстрого реагирования Мухабарата, вооруженные легким и полутяжелым оружием.
Административное бюро
Управление 2 - Администрация
Отвечало за все административные дела. Управление 2 было разделено на ряд подразделений:
Платежи и подарки
Земля и жилье
Аудит
Безопасность
Реестр
Обработка текста и набор текста
Общественные запросы
Управление 10 - Управление по правовым вопросам
Отвечало за все юридические вопросы Мухабарата. Представляло Мухабарата в совместных комитетах с другими правительственными ведомствами и министерствами. Также содержал суд, в котором судили заключенных Мухабарата.
Управление 11 - Счета
Находился в комплексе штаб-квартиры. Отвечал за финансовые дела и заработную плату во всех управлениях, кроме Управления 1.
Управление 13 - Медицинский отдел
Находился в комплексе штаб-квартиры. Отвечал за медицинские осмотры новобранцев и медицинское обслуживание членов Мухабарата.
Управление 15 - Транспортные средства
Отвечало за транспортные средства Мухабарата и их обслуживание.
Управление 16 - Физическое предприятие