К началу похода 48 года до н. э. за Цезарем стояли Италия, Галлия, Испания, Сицилия, Сардиния и Корсика, за Помпеем остальные части империи и клиентельные княжества Востока. Основной областью набора войск Цезаря оставалась Галлия. Все это означало, что Помпей опирался только на восточную, азиатскую часть империи, тогда как за Цезарем стояли европейские, населенные преимущественно индогерманцами территории. Разделение империи между двумя партиями, если не считать Африки, было таким же, что и шестнадцать лет спустя, когда Октавиан, будущий Август, и Антоний начали решающую военную кампанию.
Эту разницу ощущали многие, не в последнюю очередь из-за пропаганды Октавиана, которая пробуждала римско-италийские национальные чувства, когда столкновение европейской и азиатской частей империи и связь Антония с египетской царицей Клеопатрой, а также ее активное участие в борьбе делали более ощутимой эту разницу. Когда Цезарь и Помпей начали решающую военную кампанию, соотношение сил было равным, и то, что Цезарь осознавал демографическую разницу между обеими сферами власти, следует из характеристики войска Помпея, которую он дает в начале описания похода. Оно состояло из восьми легионов римских граждан, еще два находились на подходе, в целом более 40 000 человек. К тому же у него было 11 200 человек легких отрядов, кавалерия, лучники и катапульты.
Таким образом, основной упор делался на легионы, состоящие из римских граждан. В повествовании Цезаря общее подразделение войска Помпея прямо противоположное. Описание вспомогательных групп из восточных частей империи и перечисление союзных восточных княжеств занимает в пять раз больше места, чем описание легионов, и иноземные названия встречаются так часто, что поневоле чувствуешь преднамеренность: «… (у него) девять легионов были образованы из римских граждан, пять он привел с собой из Италии, один легион ветеранов был из Киликии… один легион ветеранов с Крита и из Македонии… два происходили из Азии, их набрал консул Лентул.
Кроме того, Помпей распределил по этим легионам большое число солдат из Фессалии, Беоции, Ахайи и Эпира. Сверх того, он ожидал два легиона из Сирии под командованием Сципиона. У него было три тысячи лучников с Крита, из Спарты, с Понта, из Сирии и других государств, две когорты пращников по шестьсот человек и семь тысяч кавалерии. Из них шестьсот привел Дейотар из Галатии, пятьсот Ариобарзан из Каппадокии. Почти столько же предоставил Котий из Фракии, приславший их под командованием своего сына Садала. Двести происходили из Македонии под началом Раскипола, пятьсот доставил на кораблях Помпей Младший. Это были галлы и германцы, которых Габиний оставил царю Птолемею в качестве телохранителей. Восемьсот Помпей набрал из собственных рабов и пастухов. Триста прислали Тракондарий Кастор и Домнилай из Галло-Греции, двести дал Антиох Коммагенский из Сирии, которого Помпей щедро вознаградил, из них большая часть была конными стрелками. К ним он присоединил дарданов, бессов… македонцев, фессалийцев и других до вышеуказанного количества. Базами снабжения служили Фессалия, Азия, Египет, Крит, Триполь».
Это обилие восточных названий свидетельствует о стремлении Цезаря посредством перечисления войск обозначить территорию, стоящую за Помпеем, и охарактеризовать ее как восточную. Пусть даже явно ощущается преднамеренность, это доказывает, что Цезарь осознавал разницу между двумя частями империи.
Второй поход гражданской войны Цезарь тоже начал вопреки античной практике — в начале зимы. Хотя по прибытии в Брундизий он обнаружил, что еще не все было подготовлено и явно не хватало транспортного флота, 4 января 48 г. до н. э. Цезарь вышел в море и на следующий день с большей частью войска достиг берегов Эпира (Албания). Несмотря на то, что флот противника под командованием Бибула контролировал море, к этому сроку никто не ожидал переправы. Высадка Цезаря застала Помпея врасплох, и целый ряд прибрежных городов попали в его руки. При этом в благоприятном для Цезаря положении он все-таки попытался разрешить ситуацию переговорным путем.
Предложение состояло в следующем: Цезарь и Помпей в течение трех дней должны были дать клятву распустить войска, а сенат и народ в Риме — установить условия мира. Цезарь надеялся, что он как консул сумеет уладить на форуме дела в свою пользу. Помпей грубо отказался от всяких переговоров. Он знал, что при таком раскладе внешне он сохранит уважение, но политически останется в тени Цезаря. Предложение начать переговоры, исходившее от командования флотом Помпея, за которое Цезарь жадно ухватился, так как посчитал его ответом на свои предложения, оказалось обманным маневром. Командование флотом, вынужденное из-за оккупации Цезаря доставлять воду и продовольствие издалека, хотело этой уловкой облегчить себе обеспечение провиантом.