После так называемой революции 18 фрюктидора[170] Бонапарт приказал своим генералам собрать адреса от своих дивизий в поддержку этого coup d'etat {государственного переворота. Ред.}; однако Бернадот сначала заявил протест против этого, затем демонстративно выразил свое крайнее нежелание выполнить это распоряжение и, в конце концов, отправил Директории адрес, однако с содержанием, совершенно обратным тому, какое от него требовалось, и притом переслал его не через Бонапарта. Последний, проездом в Париж, куда он направлялся, чтобы вручить Директории Кампоформийский договор, посетил Бернадота в его главной квартире в Удине и осыпал его лестью, но на следующий день приказом из Милана лишил его половины его дивизии из Рейнской армии, а другую половину приказал отвести обратно во Францию. После долгих увещеваний, улаживаний разногласий и новых распрей Бернадота, наконец, убедили принять пост посла в Вене. Здесь, действуя согласно инструкциям Талейрана, он занял примирительную позицию, которую парижские газеты, по наущению Бонапарта и его братьев, объявили преисполненной роялистскими тенденциями, причем в доказательство этого обвинения стали широко распространять слухи о снятии им трехцветного флага, висевшего над входом в его отель, и республиканских кокард с шляп его свиты. Получив за это выговор от Директории, Бернадот 13 апреля 1798 г., в годовщину антиякобинской демонстрации в Вене, поднял трехцветный флаг с надписью: «Свобода, равенство, братство», после чего его отель подвергся нападению венской толпы, флаг был сожжен, а его жизни угрожала опасность. Так как австрийское правительство отказалось дать требуемое удовлетворение, то Бернадот вместе со всем своим посольством удалился в Раштатт; однако Директория, по совету Бонапарта, который сам приложил руку к тому, чтобы вызвать этот скандал, замяла дело и оставила своего представителя без поддержки.
Вступление Бернадота в родственные отношения с семьей Бонапарта благодаря его браку, в августе 1798 г., с мадмуазель Дезире Клари, дочерью марсельского купца и свояченицей Жозефа Бонапарта, по-видимому, только усилило его враждебность к Наполеону. Занимая пост командующего обсервационной армией на Верхнем Рейне в 1799 г., он оказался неспособным выполнять возложенные на него обязанности и, таким образом, заранее подтвердил правильность мнения Наполеона, высказанного им на острове Св. Елены, что он больше подходил для роли подчиненного, чем главнокомандующего. Возглавив военное министерство, после emeute {столкновения, бунта, переворота. Ред.} в Директории 30 прериаля[171], он в меньшей степени проявил себя своими планами военных операций, чем своими интригами с якобинцами, опираясь на возрождающееся влияние которых, он пытался завербовать себе личных сторонников в армии. И вот однажды утром, 13 сентября 1799 г., он в «Moniteur» прочел сообщение о своей отставке, и не подозревая о том, что подал о ней прошение. Эту шутку сыграли с ним связанные с Бонапартом члены Директории Сиейес и Роже Дюко.