Законом отменялись все классовые ограничения в военной службе, устанавливался новый порядок ее прохождения. В Красную Армию призывались все граждане СССР, которым исполнилось 19 лет, а окончившие среднюю школу — в 18 лет. Устанавливались и новые сроки службы для красноармейского и младшего начальствующего состава (в сухопутных войсках и авиации — 3 года).
Еще раньше (в мае 1939 года) срок службы на флоте был доведен до 5 лет, в частях связи и береговой артиллерии до 4, в специальных частях — до 3 лет. Это позволило значительно увеличить численность РККА и РККФ.
Летом 1939 года Совет Народных Комиссаров СССР утвердил новую организационную структуру Наркомата ВМФ.
Нарком утвердил и новое «Положение об организации и работе Главного морского штаба РКВМФ», в котором было четко определено, что он является органом боевого управления народного комиссара ВМФ по подготовке и использованию сил флота для обеспечения морской обороны СССР.
На Главный морской штаб возлагались следующие задачи:
— разработка и согласование с Генеральным штабом РККА мероприятий по совместным действиям РККА
— разработка оперативных планов РКВМФ и вопросов оперативного использования флотов, флотилий и органов тыла по обороне СССР;
— разработка организационной структуры и штатов флота по мирному и военному времени;
— разработка вопросов и схемы организационно-мобилизационного развертывания сил и средств флота;
— подготовка директивных указаний по обеспечению постоянной мобилизационной готовности флота;
— изучение и проверка оперативной, мобилизационной и материальной подготовленности флотов и флотилий;
— разработка всех необходимых мероприятий, связанных с повышением их боевой готовности;
— разработка положений и наставлений по вождению соединений флотов и флотилий;
— разработка организации тыла и указаний по материальному обеспечению РКВМФ в мирное и военное время, ежегодных и перспективных планов организационных мероприятий по флотам и флотилиям;
— разработка (в соответствии с потребностями флота) планов и заданий по оперативной подготовке морских и речных театров в военное время;
— разработка специальных заданий по подготовке и использованию морских, речных и т.п. путей сообщения в мирное и военное время;
— планирование и обеспечение морских, речных и др. воинских перевозок;
— руководство специальной, морской, оборонной подготовкой личного состава и средств водного транспорта к использованию их по военному времени;
— руководство гидрографической службой флота;
— разработка тактико-технических заданий по строительству и модернизации кораблей, батарей, баз, складов и путей сообщения на театрах и по созданию новых;
— усовершенствование состоящих на вооружении боевых и технических средств флота;
— комплектование флотов и флотилий рядовым и младшим начсоставом по мирному и военному времени;
— учет обеспеченности РКВМФ людскими мобилизационными ресурсами по военному времени;
— подготовка наставлений оперативно-организационного и мобилизационного характера;
— руководство и контроль (по указанию НК ВМФ) за оперативной и боевой подготовкой флотов (флотилий), береговой обороной и приданными ей сухопутными частями, морской авиацией, штабами и органами тыла;
— руководство (по указанию НК ВМФ) разведывательной работой;
— участие в разработке спецсмет и планов гражданских наркоматов;
— руководство и контроль за эксплуатацией железнодорожных и водных путей и подвижного состава военного флота;
— обеспечение кредитами флотских перевозок;
— изучение опыта войн и флотов иностранных государств и, в первую очередь, вероятных противников;
— руководство шифровально-штабной службой и скрытым управлением на флотах и флотилиях;
— участие в маневрах и учениях флотов и флотилий, их изучение, анализ и выводы;
— контроль за выполнением указаний НК ВМФ в части касающихся Главного морского штаба и отданных штабом директив.
В связи с возрастанием задач, поставленных перед Главным морским штабом, была несколько изменена и его организационная структура.
В связи с начавшейся агрессией Германии против Польши в стране был принят ряд других мер, направленных на повышение боевой готовности армии и флота. Уже 4 сентября 1939 года народный комиссар обороны СССР потребовал от командования Киевского, Белорусского, Ленинградского, Калининского, Московского и Харьковского военных округов провести мероприятия по усилению своих войск. В боевую готовность были приведены части западных укрепленных районов, средства ПВО и авиация.
8 сентября Военные советы Киевского и Белорусского военных округов получили приказ наркома начать скрытную оперативную переброску своих войск на запад. На базе этих округов были созданы Белорусский и Украинский фронты.