17 марта 1954 года 4-й спецотдел был введен в структуру КГБ, и его начальником стал П. Ф. Кузнецов. 2 июля 1959 года он вошел в состав Оперативно-технического управления (далее — ОТУ) КГБ как 4-й отдел.
Известно, что в 1962 году в рамках секретной операции «Анадырь» по доставке на Кубу баллистических ракет в группу советских контрразведчиков вошли также и специалисты радиоконтрразведки.
В результате радиоконтрразведка засекла выход в эфир агентурного передатчика в особом режиме, когда сеанс длился считанные секунды, а сообщение как бы выстреливалось. Удалось запеленговать агентурный радиопередатчик и захватить с поличным резидента ЦРУ Клемента Инклана.
В 1964 году с целью объединения усилий всех радиотехнических служб 4-й отдел (радиоконтрразведки) ОТУ был передан в состав 8-е ГУ КГБ как 11-й отдел. На протяжении 1964—72 годов службами радиоконтрразведки и радиоразведки 8-го ГУ КГБ руководил Владимир Иванович Бондаренко, будучи заместителем начальника Главка.
Согласно годового отчета 8-го ГУ КГБ в ноябре 1968 года Спецслужба КГБ (войска радиоразведки) осуществляла перехват шифрованной переписки от 2002 действующих радиостанций 115 стран мира. Подразделения радиоконтрразведки разрабатывали 24 радиоцентра органов разведки капиталистических стран, которые обеспечивали связь со 108 агентурными точками.
Было запеленговано 3 новых агентурных радиостанции во Вьетнаме. Агентурных радиосвязей с советской территории не было выявлено. Розыскными подразделениями установлены в СССР адреса 500 владельцев незарегистрированных радиостанций.
В 1973 году на базе дешифровального управления 8-го ГУ было создано новое 16-е управление (радиоэлектронной разведки) КГБ. В связи с этим отдел радиоконтрразведки был реорганизован в Службу «Р» 2-го ГУ (контрразведки) КГБ, а в 1978 году — Управление «Р» 2-го ГУ КГБ.
25 декабря 1991 года, после развала СССР и ликвидации КГБ, радиоконтрразведка была реорганизована в Управление «Р» 2-го ГУ Министерства безопасности РФ, а 12 апреля 1995 года — Управление «Р» 2-го ГУ Федеральной службы безопасности РФ (далее — ФСБ).
На протяжении всей истории СССР органы государственной безопасности и внутренних дел под воздействием внешних обстоятельств и роста объёма задач постоянно реорганизовывались, изменяли свою структуру и название. Соответственно менялась структура и название подразделений радиоконтрразведки (см. таблицу).
5. Специальная радиотехника
Исследовательские работы по вопросам технического обеспечения радиоразведки и прослушки начал проводить с 1926 года Научно-исследовательский институт связи (далее — НИИС) РККА.
В 1929 году в структуре НИИС были созданы следующие спецлаборатории:
— секретного телеграфирования отдела радиопередатчиков;
— пеленгаторная отдела радиоприёмников;
— телефонной аппаратуры и секретного телефонирования телеграфно-телефонного отдела;
— станций прослушивания телеграфно-телефонного отдела;
— отдела применения.
Разумеется, совершенствование организационных форм и методов ведения радиоразведки было бы невозможно без технического вооружения подразделений.
Сначала подразделениями радиоразведки использовался так называемый пеленгатор Баженова, который работал еще в годы Первой Мировой войны. В 1929 году вступил в строй двуколочный пеленгатор «52ПД». Вместо длинноволнового (далее — ДВ) 4-лампового приемника стали поступать новые, более высокочувствительные радиоприемники Особого бюро при ОГПУ. Такие радиоприемники состояли в штате разведывательных станций в Минске, Пскове, Слуцке и Кингисеппе.
В январе 1933 года НИИС был реорганизован в научно-исследовательский институт связи и электромеханики (дальше — НИИСЭМ) в составе 10 отделов, среди которой были отдел специальной телеграфно-телефонной и радиосвязи (начальник — Исай Герцевич Кляцкин) и отдел радиоразведки (начальник — В. М. Никитин).
В январе 1935 года НИИСЭМ был разделен на 2 института: НИИС по тематике связи и радиоразведки, подчинённый Управлению связи РККА и научно-исследовательский технический институт (далее — НИТИ) по тематике «особой техники», подчинённый Техническому управлению РККА.
Отдел специальной телеграфно-телефонной и радиосвязи (начальник — Николай Иванович Болховитин) и отдел радиоразведки (начальник — С. И. Андреев) вошли в состав НИИС, где в январе 1936 года был создан новый отдел радиоразведывательных средств, начальником которого стал Андреев.
В мае 1938 года НИИС и НИТИ были объединены в единый научно-исследовательский институт связи и особой техники (далее — НИИСТ) РККА, который с 1939 года начал проведение исследований в сфере радиоразведки для решения задач по созданию автоматизированной радиопеленгаторной системы и разработки автоматизированного электронно-лучевого пеленгатора.
С началом войны под военные цели была реорганизована и работа НИИСТ, в котором с целью обеспечения перехвата и анализа разных систем связи противника были созданы 2 научно-исследовательских отдела: НИО-1 и НИО-2.