Осужденные, привлекавшиеся на работу в Отдел ОТ, часто за добросовестное отношение к работе досрочно освобождались из заключения. Так, в соответствии с Постановлением СМ СССР от 29 июля 1950 года досрочно были освобождены с восстановлением во всех правах специалисты, особо отличившиеся в создании специальной аппаратуры: Брыксин Иван Емельянович, Владимиров Василий Григорьевич, Степаненко Вячеслав Васильевич, Котиков Александр Николаевич, Измайлов Гумер Ахатович, Фаинберг Лазарь Исакович, Геншин Евгений Сергеевич, Проценко Владимир Михайлович, Васильев Николай Николаевич.
Заместителю министра госбезопасности по кадрам В. Е. Макарову предлагалось оформить прием освобожденных специалистов на работу в Отдел ОТ по негласному штату. Начальнику Главного Управления милиции МГБ Леонтьеву поручалось выдать паспорта освобожденным и прописать их в Москве.
В августе 1951 года происходит смена руководства. Министром госбезопасности был назначен С. Д. Игнатьев. Во время сдачи-приема дел от В. С. Абакумова была проведена ревизия всех подразделений МГБ. 21 сентября 1951 года Игнатьев поручил провести проверку работы Отдела ОТ, и в марте 1952 года она была закончена.
20 марта 1952 года приказ МГБ отметил большое количество серьезных недостатков в работе Отдела. Критике подверглись даже необходимые нововведения, сделанные Железовым, но не согласованные во время с руководством.
Министром Игнатьевым было констатировано, что созданная Отделом техника не удовлетворяла возросшим требованиям оперативной работы, как по своему техническому уровню, так и по количеству изготовленной аппаратуры.
В Отделе, по мнению руководства МГБ, было неправильно организовано планирование работ, не было перспективного плана. Неправильно велось техническое планирование, не существовало технических норм и хронометража по серийному производству. Лимиты по стоимости научно-исследовательских работ (далее – НИР), расценки и нормы на изготовляемую серийную продукцию не составлялись.
Отделом не была использована возможность заказа в промышленности многих не представлявших особого секрета типов аппаратов и приборов, различного вида радиостанций, различной аппаратуры для погранвойск, фотокиноаппаратуры и т. д.
Было отмечено, что бывший главный инженер Отдела Васильев своих функций не исполнял и по существу самоустранился от технического руководства. Технический совет не был создан. Организованные 2–3 года назад технические советы в лабораториях работали плохо. Производилось дорогостоящее и неэффективное экспериментирование.
Существовала порочная практика широкого использования труда заключенных, при этом не только квалифицированных специалистов, но и лиц низкой квалификации. Отсутствовали постоянные штаты подразделений. В отделе работало 114 сотрудников, находящихся между собой в родственных связях.
Без санкции руководства МГБ было создано несколько новых подразделений: Управление Кучинского куста, Бюро технической документации, Группа капитального строительства, Центральная техническая библиотека.
Учитывая вышеизложенное, Железову был объявлен строгий выговор. Он был предупрежден, что если в течение 3-х месяцев не будет наведен порядок в работе Отдела, он будет снят с занимаемого поста. Главным инженером Отдела был назначен Владимир Леонидович Доброжанский, а заместителем начальника Отдела – Евгений Иванович Геронин.
В дальнейшем планирование НИР необходимо было проводить с обязательным составлением аванпроекта, определяющего технические пути решения задач, трудоемкость и перечень необходимых научных исследований. Была поставлена задача, чтобы планирование серийного производства производилось по строгим техническим нормам.
Для этого надо было организовать в Отделе нормирование выполняемых работ. Включение в план новых НИР и серийное изготовление аппаратуры надо было производить только после рассмотрения их Ученым советом и утверждения руководством МГБ СССР.
В 2-недельный срок предлагалось представить на утверждение структуру и расстановку штатов Отдела с учетом организации лаборатории для нужд 1-го ГУ, отделения кадров, отделения по размещению заказов в промышленности и хозяйственных подразделений при объектах № 9 и № 2 в Кучино.
В месячный срок необходимо было подготовить предложения по переводу некоторых отделений лаборатории № 5 за город на объект «Кучино», а также представить соображения по строительству необходимых помещений и переводу в последующем за город всей лаборатории.
Заместителю министра госбезопасности Савченко предлагалось представить предложения по улучшению работы Ученого совета Министерства, предусмотрев создание при нем Бюро по изобретениям и рационализации. В компетенцию хозяйственного управления МГБ передавались все строительные работы, в том числе и жилые дома Отдела, который освобождался от несвойственных ему функций.
Предлагалось в 1953 году построить 2 жилых дома для рабочих завода в Кучино общей площадью в 3000 кв. метров и ввести дополнительно в штат Отдела автобус для перевозки сотрудников, 1 легковую и 2 грузовых автомашины.