Августин видел в самозарождении живых существ выявление божественного произвола, при котором косная материя оживляется «животворящим духом», «невидимыми духовными семенами». Этим Августин утвердил учение о самозарождении как вполне соответствующее догмам христианской церкви.
Средневековье мало что добавило к этой антинаучной концепции. В средние века любая философская мысль могла существовать только в богословской оболочке, в оболочке той или иной доктрины церкви. Вопросы естествознания были отодвинуты на задний план. Об окружающей природе судили не на основании наблюдений и опыта, а на основании изучения библии и богословских сочинений. Лишь весьма скудные сведения по вопросам математики, астрономии и медицины проникали в Европу с Востока.
Таким же путем, в виде нередко весьма искаженных переводов, доходили до европейских народов и сочинения Аристотеля. Сначала его учение казалось опасным, но затем, когда церковь поняла пригодность этого учения для многих своих целей, она возвела Аристотеля в ранг «предшественника Христа по вопросам естествознания». При этом, по меткому выражению Ленина, «схоластика и поповщина взяли мертвое у Аристотеля, а не живо е...» (В. И. Ленин. Философские тетради. Госполитиздат, 1947, стр. 304.)
В частности, по вопросу о происхождении жизни было широко развито учение о самозарождении организмов, сущность которого христианские богословы видели в одушевлении безжизненной материи «вечным божественным духом».
В качестве примера здесь можно сослаться на одного из наиболее известных богословов средних веков Фому Аквинского, учение которого и по сей день признается католической церковью единственной истинной философией. В своих сочинениях Фома Аквинский учил, что живые существа возникают путем одухотворения безжизненной материи. Так, в частности, при гниении морской тины и унавоженной земли образуются лягушки, змеи, рыбы. Даже те черви, которые в аду мучают грешников, по мнению Фомы Аквинского, возникают там в результате гниения грехов. Фома вообще всячески поддерживал и пропагандировал воинствующую демонологию. Он считал, что дьявол реально существует как глава целого полчища демонов. На этом основании он утверждал, что возникновение паразитов, вредящих человеку, может происходить не только по повелению божьему, но и в результате козней дьявола и подчиненных ему духов зла. Практическим выводом из этого положения явились многочисленные в средние века процессы над «ведьмами», которых обвиняли в том, что они напускали мышей и других вредителей на поля и таким образом губили посевы.
В реакционном учении Фомы Аквинского западная христианская церковь возвела в догму принцип внезапного самозарождения организмов, согласно которому живые существа возникают из безжизненной материи вследствие ее одушевления духовным началом.
Этого же принципа придерживаются и богословские авторитеты восточной церкви. Так, например, Дмитрий, епископ Ростовский, живший во времена Петра I, таким, весьма курьезным, на наш современный взгляд, образом отстаивал в своих сочинениях этот принцип. Он писал, что во время всемирного потопа Ной не брал к себе в ковчег мышей, жаб, скорпионов, тараканов и комаров, всех тех, которые «от блата и согнития родятся... и от росы небесной зачинаются». Все эти живые существа при потопе погибли и «паки по потопе от таковых же веществ родишися».
И по сей день как христианская, так и все другие религии мира утверждают, что живые существа возникали и возникают будто бы вследствие творческого акта божества сразу в готовом виде путем самозарождения, вне какой-либо связи с развитием материи.
Однако углубленное изучение живой природы позволило ученым установить, что такого внезапного самозарождения живых существ нигде в окружающем мире не происходит. Для более высокоразвитых организмов, в частности для червей, насекомых, пресмыкающихся и земноводных, это было доказано еще в середине XVII века. Дальнейшие исследования подтвердили это положение и для более просто организованных живых существ, даже для простейших микроорганизмов, которые, хотя и невидимо для невооруженного глаза, всюду нас окружают, населяют землю, воду и воздух.
Во второй половине прошлого века благодаря блестящим работам знаменитого французского ученого Л. Пастера и других исследователей было с несомненностью доказано, что и эти наиболее примитивные живые существа всегда возникают только путем рождения от подобных им организмов.
Таким образом, самый «факт» внезапного возникновения живых существ, который представители разнообразных религий пытались объяснить как оживление косной материи животворящим духом, «факт», на котором основывались все религиозные учения о происхождении жизни, оказался несуществующим, призрачным, основанным на неверном наблюдении и невежественном его истолковании.