Не очень ясным представляется отношение ессеев к Иерусалимскому храму, к храмовому культу и связанным с ним жертвоприношениям. Согласно Филону, ессеи отвергали приношения в жертву животных, так как считали, что истинное благочестие заключается в чистоте убеждений. По свидетельству Иосифа Флавия, «в храм ессеи доставляют пожертвования, но сами они не занимаются жертвоприношениями, признавая другие способы очищения более целесообразными. Поэтому им запрещен доступ в общий храм, и они совершают свое богослужение отдельно». В данном сообщении Иосифа имеется несколько неясных моментов. Не случайно оно вызвало много кривотолков. По-видимому, ессеи посылали обычные приношения в Иерусалимский храм, но отвергали жертвенный культ. Это означает, что разрыв ессеев с храмом не был окончательным и полным.
Общинная жизнь ессеев влекла за собою общие обеды, которые носили характер священных трапез. В столовую, словно в святилище, никто из братьев не допускался, если предварительно не омывал тело холодной водой. Они усаживались вокруг стола в строжайшей тишине. Трапеза открывалась и оканчивалась молитвой, которую читал священник. У ессеев считалось честью постоянно носить белую одежду. Присоединяющийся к секте получал предварительно передник и белое облачение.
Ессеи вели аскетический образ жизни, строго соблюдали чистоту ритуала. Иосиф Флавий отмечает, что ессеи всегда проявляли большую умеренность в пище, никто из них не ел и не пил в избытке. Воздержность ессеев подчеркивает и Филон. Большое значение сектанты придавали ритуальным омовениям. Посредством священных трапез и ежедневных омовений ессеи надеялись истребить «нечистоту» и установить мистическое единение между членами общины.
Всякий, желающий присоединиться к секте ессеев, прежде чем быть принятым туда, в течение года вел такой же образ жизни, как и ее члены. Если он выдерживал испытание воздержности, то его допускали ближе к общине, разрешали участвовать в омовениях водой, но не допускали к общим трапезам. Характер новичка подвергался испытанию еще в течение двух лет. И лишь после этого срока его принимали в братство. Ессея, уличенного в тяжких проступках, исключали из общины. Для убежденного сектанта это означало смерть от голода, так как он не мог принимать пищу от несобрата.
Ессеи строже, чем все другие иудеи, соблюдали субботний покой. Отличительные черты имел у них также обряд богослужения. До восхода солнца ессеи воздерживались от всяких дел. Каждое утро они обращали свои молитвы к солнцу, как будто хотели с их помощью вымолить его восход. О почтительном отношении ессеев к солнцу свидетельствует и то, что они укрывались от него при отправлении своих естественных нужд. Можно сделать предположение, что солнце занимало определенное место в религиозных представлениях ессеев.
Последователи секты ессеев утверждали, что в жизни людей ничто не может произойти вопреки предопределению судьбы. Они считали, что обладают даром прорицания, полученным в результате непосредственной духовной связи с богом. Ессеи верили в бессмертие души. Они полагали, что она происходит из тончайшего эфира и находится в теле, как в темнице. Освобожденная от телесных уз душа уносится к небесам. Ессеи почитали ангелов, божественных посредствующих существ. Вступающий в секту, прежде чем быть допущенным к общим трапезам, был обязан дать своим собратьям клятву в том, что он будет хранить в тайне имена ангелов.
Возникновение и развитие секты ессеев было обусловлено социальными и политическими потрясениями, которые переносило население Палестины. Плиний Старший правильно отметил, что состав этой секты постоянно пополнялся людьми, уставшими от жизни, испытавшими превратности судьбы. В общины ессеев вливались все те элементы, которые мечтали избавиться от жизненных невзгод путем аскетизма и благочестия. В таком бегстве от жизни выражался их пассивный протест против социального гнета и политического бесправия. Отказываясь от активной борьбы с угнетателями и уводя от нее своих приверженцев в сторону религиозного фанатизма, ессеи наносили большой вред общему делу борьбы народных масс против эксплуататорского строя. Своим бегством от жизни, своим прославлением аскетизма и бедности ессеи, по существу, отвлекали народные массы от борьбы с эксплуататорами.
В первой половине I в. до н. э. Рим настойчиво стремился окончательно подчинить Иудею своей власти. Непрерывное ослабление Хасмонейской династии в значительной мере облегчало Риму выполнение этой задачи. В 63 г. до н. э. римский полководец Помпей взял Иерусалим и тем самым открыл период бесцеремонного вмешательства римлян во внутренние дела Иудеи. Они стали произвольно назначать на иудейский престол своих ставленников.