Работа над источниками начала XVII века заняла у С.Ф. Платонова около восьми лет. Несколько важнейших памятников, относящихся к событиям и лицам Смутного времени, молодой ученый подготовил к изданию в серии «Русская историческая библиотека»[245]. Данная публикация получила благожелательный отзыв В.О. Ключевского, который обратился к С.Ф. Платонову с дружеским приветствием[246]. К 1891 году материальное положение историка окрепло, он прекратил занятия в средней школе и сосредоточился на университетском преподавании. «Трудиться приходилось не меньше, чем в предшествующие годы, – отметил впоследствии С.Ф. Платонов, – но труд более удовлетворял»[247]. Он читал общий курс русской истории, специальные курсы по отдельным эпохам, вел обязательные для студентов историко-филологического факультета семинарские занятия. Именно отсюда вышли ученики С.Ф. Платонова, составившие со временем крупную научную школу: среди них были Н.П. Павлов-Сильванский, С.В. Рождественский, А.Е. Пресняков, И.И. Лanno, М.А. Полиевктов, позже – П.Г. Васенко, А.И. Заозерский, Б.А. Романов, П.А Садиков и другие.
Издание обнаруженных в ходе работы над диссертацией текстов привело С.Ф. Платонова в число постоянных сотрудников Археографической комиссии. С 1894 года он приступил к подготовке для публикации в Полном собрании русских летописей обширного официального свода XVII века, так называемой «Никоновской летописи»[248]. Много сил отнимала редакционная работа в «Журнале Министерства народного просвещения». Вместе с тем, чтобы оправдать доверие факультета, следовало выделить время для докторской диссертации. В начале 1896 года С.Ф. Платонов написал первые строки своего главного научного труда, названного «Очерки по истории Смуты в Московском государстве XVI–XVII веков».
Основным итогом Смутной эпохи С.Ф. Платонов считал перемену «господствующего класса», в результате чего сложился порядок, обусловивший дальнейший ход исторического развития России. Именно к такому выводу должно было привести читателя изложение книги. Чтобы представить обстановку, в которой проходили события Смуты, автор предпослал своему исследованию обстоятельный историко-географический очерк. Изучение различных областей России помогло С.Ф. Платонову сделать ценные научные выводы[249].
Смута была далеко не случайным явлением – причиной ее явился глубокий кризис, охвативший Московское государство во второй половине XVI века. Приняв вывод В.О. Ключевского о политической стороне конфликта между самодержавной властью и княжеской аристократией, претендовавшей на участие в управлении страной, С.Ф. Платонов уделил большое внимание существу опричной реформы Ивана Грозного. Рассмотрение территориального состава опричнины привело историка к мысли, что в ней произошло перераспределение крупных земельных владений княжат в пользу служилого дворянства. Таким образом, Иван Грозный уничтожил материальную основу политических претензий старой знати, а казнями и ссылками он удалил представителей этой знати из дворца и высших учреждений[250]. Вместе с тем насаждение мелкого служилого землевладения закономерно привело к усилению личной зависимости крестьян от помещиков и способствовало распространению крепостного права. С этим процессом связано возникновение социальных противоречий в жизни Московского государства. Стремление крестьян освободиться от зависимости привело к их массовому переселению на окраины, где формировалась взрывоопасная среда казачества. К концу царствования Ивана Грозного общий кризис обозначился в полной степени. Московская знать страдала от террора и потери земель, дворяне – от ухода рабочей силы, крестьяне были озлоблены на правительство и землевладельцев из-за потери свободы и хозяйственного разорения.
В истории самой Смуты историк выделил три периода. Первый – династический охватывает борьбу между различными претендентами за московский престол. Эта борьба началась еще при жизни Федора Ивановича, последнего царя династии Рюриковичей. Она шла между боярскими родами Годуновых, Романовых и князей Шуйских. Сначала победу одержал Борис Годунов. Взойдя на престол, он отправил Романовых в ссылку. Но побежденные бояре выдвинули Самозванца, назвавшего себя сыном Ивана Грозного. Лжедмитрий сумел возмутить южные окраины государства и, опираясь на эту силу, овладел Москвой. Так борьба за престол, по мнению С.Ф. Платонова, вовлекла народные массы. Не желая повиноваться Самозванцу, московские бояре свергли его и возвели на престол князя Василия Ивановича Шуйского.