Вследствие вышеизложенною и по приказанию Управляющего Морским Министерством, Главный Морской Штаб представляет на благоусмотрение Адмиралтейств- Совета о зачислении шхуны “Крейсерок” в IV-йранг судов, с переводом ее на время плавания для охраны Тюленьего острова в III-й ранг». На следующий день вышел приказ по Морскому ведомству № 10 о зачислении «Крейсерка» в состав флота, а 11 февраля 1889 г. — приказ по Морскому ведомству № 17 о зачислении в ранг кораблей (он полностью повторял формулировку процитированного выше рапорта).
В 1889 г. «Крейсерок» под командованием лейтенанта А.П. Дружинина вновь вышел на охрану острова Тюлений. Эта кампания оказалась для него последней. Караул был высажен на остров 13 июня, а шхуна ушла в залив Терпения проводить гидрографические работы.
Возвращение «Крейсерка» ожидалось в конце октября (15-го он должен был снять караул с острова). Однако во Владивосток шхуна не пришла. 8 ноября командир Владивостокского порта контр-адмирал П.И. Ермолаев послал тревожную телеграмму в Санкт-Петербург, в Морское министерство. В ней он писал: «Шхуна “Крейсерок” еще не возвратилась, начинаю беспокоиться, прошу исходатайствовать разрешение послать пароход Добровольного флота “Владивосток” [к] обоим берегам [острова Сахалин] до Тюленьего острова. “Владивосток” фрахтом не занят и агент соглашается». На эту телеграмму управляющим Морским министерством вице-адмиралом Н.М. Чихачевым была наложена следующая резолюция: «Не могу понять цели посылки парохода, оба берега обитаемы, заселены, имеют туземные лодки для сообщения, если что-нибудь случилось с “Крейсерком” у берегов, то экипаж вполне обеспечен помощью. Спросить Ермолаева, какая цель посылки “Владивостока”?». Впрочем, через два дня министр разрешил послать для поисков пароход, который вышел 12 ноября. 27 ноября командир «Владивостока» сообщил туманные и неутешительные вести о том, что последний раз «Крейсерок» видели около Крильонского маяка, куда шхуна, по сведениям смотрителя, заходила 25 октября (пришла в 7 часов утра, ушла — в 8 вечера). Помимо команды «Крейсерка», на ее борту находилось восемь американцев со шхуны «Роза», разбившейся у мыса Терпения, и один русский матрос с нее же. Также в телеграмме говорилось о том, что кораблем командует лейтенант Дружинин, лейтенант Налимов погиб и погребен на мысе Терпения надзирателем Тарайки (поселка, где содержались ссыльнокаторжные) Вороновым, а квартирмейстер Корсунцев поправляется в лазарете на посту Корсаковском. Командир «Владивостока» планировал обойти остров Рейсири и западный берег Сахалина. В случае если он не обнаружит шхуну и там, он должен был сообщить об этом из Нагасаки во Владивосток. Понятно, что такая информация вызвала тревогу и недоумение у командования. Посыпались запросы и телеграммы. Ситуацию удалось прояснить лишь после того, как командир парохода привез копию протокола опроса единственного уцелевшего свидетеля трагедии — квартирмейстера Корсунцева. Его показания послужили основой для всех последующих газетных и других публикаций. Приведем этот документ полностью.