В том же месяце на Лубянке приступила к работе специальная комиссия во главе с новым начальником Иностранного отдела В. Г. Деканозовым по проверке всех оперативных работников разведки. Комиссии предстояло выяснить, как разоблачаются изменники, авантюристы и сомнительные типы, затесавшиеся в ряды органов госбезопасности.
Одновременно «бдительный» чекист Гукасов, сослуживец Судоплатова по Харькову, предложил партийному комитету 5-го отдела ГУГБ НКВД обратить внимание на связи Павла Анатольевича с разоблаченными врагами народа. «Падазрытэлный лычнаст, сэрдцэ гаварыт», — заявил Гукасов секретарю парткома Леоненко.
23 ноября 1938 года состоялось заседание партийного бюро. Выписка из протокола № 15 свидетельствует:
«Слушали — Персональное дело т. Судоплатова П. А.
Тов. Леоненко зачитывает обвинения, предъявляемые к т. Судоплатову, о его путаных ответах при заполнении анкетных данных, о связях с ныне разоблаченными врагами народа: Горожаниным — троцкистом, подписавшим «платформу 83», которого Судоплатов знает по работе в ГПУ УССР; с Соболь — ныне разоблаченным врагом народа, по рекомендации которой Судоплатов пришел работать в И НО; с Каминским — врагом народа, лучшим другом Судоплатова; с Быстролетовым — врагом народа, компрометирующий материал о котором Судоплатов скрывал в течение долгого времени.
Об использовании Судоплатовым служебного положения для получения из-за границы вещей для себя и своей жены, под видом оперативных надобностей уже в сентябре 1938 года.
Тов. Судоплатов дает биографическую справку о себе и своих родственниках, указывает о своем участии в Красной армии, о нахождении в плену у генерала Шкуро, в возрасте 12 лет. Судоплатов указывает, что предъявленные ему обвинения не соответствуют действительности, связь с рядом ныне разоблаченных врагов народа — Горожаниным, Каминским — была исключительно служебная, других взаимоотношений с ними не было.
В отношении связи с Соболь, Судоплатов признает, что в этом вопросе он виновен, что в данном случае он просмотрел, чему в значительной степени способствовало награждение Соболь боевым оружием руководством Наркомата».
Накал страстей на этом собрании оказался чрезвычайно высок. В своих выступлениях члены партии в выражениях не стеснялись, о чем свидетельствует все та же выписка из протокола:
«Тов. Благутин — по приходе в отдел из беседы с отдельными товарищами я получил о Судоплатове характеристику как о холуе. Отсюда, я считаю, все его последующие положения в коллективе. Посмотрите связи Судоплатова с врагами народа Горожаниным, Соболь и др., поведение Судоплатова во время прошлых собраний; его отношение к ныне разоблаченным врагам, нужно сказать прямо, обывательское. Судоплатов никогда не выступал с разоблачениями врагов, он не высказывал своего мнения, у него нет ничего партийного(…).
Тов. Дудукин — указывает, что Судоплатов попал на работу в отдел по рекомендации врага Соболь. Его тянул на работу Слуцкий, кто такой Слуцкий, нам известно. Для Судоплатова создавались особые условия, которые никто из нас не имеет. И дальше, в 1938 году Судоплатов намечается на должность пом. нач. отдела и, еще не будучи утвержденным в этой должности, Судоплатов пользуется особыми привилегиями; эти довольно странные явления, по-моему, вытекают из тех взаимоотношений, которые имел Судоплатов с быв. руководством отдела(…).