Гаплогруппа V является автохтонной («ближневосточной») для Европы и имеет возраст 10–15 тыс. лет, концентрируясь вокруг «родового гнезда» на севере Иберийского полуострова и отчасти на юго-западе Франции. Здесь разнообразие признаков достигает максимума — дает наибольшее число мутационных отличий от предкового гаплотипа. Предположение о том, что из этих территорий происходила диффузия данной гаплогруппы на северо-восток до Скандинавии и на юг до Северной Африки, выглядит сомнительным. Скорее всего, носители соответствующего генофонда были оттеснены из континентальной Европы, но оставив в пришлом населении след своего прежнего владычества. Возможно, впрочем, что некоторую роль сыграла и реваншистская экспансия (в особенности в направлении Африки). Саамы же могут расцениваться как родственники басков только в модели отступления на периферию континента, а вовсе не наступления в зону действия иных расовых типов. Гаплогруппы V нет на Кавказе, на юге Европы и на Ближнем Востоке. Но не надо забывать, что эти территории также не оставались вне влияния миграций и, напротив, были для мигрантов своеобразным перекрестком, где прокатывались экспансии во всех направлениях.
Гаплогруппа Н распространена в Европе в разных популяциях с частотой от 20 до 60 %. С меньшей частотой она обнаруживается в Северной Африке, в Сибири, на Дальнем Востоке и в Индии. Наибольшая вариабельность (а значит и древность) данной гаплогруппы наблюдается на Ближнем Востоке в некоторых популяциях. Расчетная оценка показывает, что она возникла здесь 25–30 тыс. лет назад, но проникла в Европу 15–20 тыс. лет назад.
Анализ Y-хромосомных бинарных маркеров показал, что 95 % населения Европы и Ближнего Востока можно распределить по 10 историческим родословным (различным гаплотипам). Причем 80 % носителей этих гаплотипов (европейских мужчин) являются потомками доледниковых родовых ветвей и только 20 % отражают миграции послеледникового периода.
Гаплотипы Е19 и Е18 (различные только одной точечной мутацией) появились в Европе в палеолите и их носителями являются более 50 % мужчин-европейцев.
Частота Е18 уменьшается а запада на восток и максимальна у басков. Возраст этого гаплотипа около 30 тыс. лет и представляет признак древнейшей европейской родословной. Географическое его распределение напоминает распределение гаплотипа V мтДНК.
Частота Е19 имеет обратное распределение. Этот гаплотип почти не встречается в Западной Европе. Его частота увеличивается к востоку и достигает максимуму в Польше, Венгрии и на Украине, где исчезает родственный гаплотип Е18. Самое высокое разнообразие микросателитных маркеров Е19 найдено на Украине, которая, таким образом, может претендовать на то, чтобы ее население считалось прародителем соответствующей волны миграции. В то же время географический источник миграции мог перемещаться и исходно, как мы полагаем, был вовсе не на Украине. Об этом свидетельствует отсутствие соответствующей географической закономерности для мтДНК. Возможно, данная особенность носит исключительно географический характер, каким-то образом избирательно присутствуя именно в мужской части населения. Иное объяснение требует дополнительных данных и сложных ухищрений интерпретатции.
К эпохе палеолита относятся также гаплотипы Е8 и Е9, имеющие географическое соответствие с распределением гаплотипа Н мтДНК. Прочие гапалотипы Y-маркеров имеют более позднее происхождение. В основном они связываются с ближневосточными мигрантами земледельческих цивилизаций. Но возраст одного из гаплотипов имеет мутацию с возрастом не более 4000 лет, сохранившуюся до современности лишь на территории северо-востока Европы (что позволяет некоторым ученым опрометчиво считать эту зону местом возникновения данной мутации).
Судя по исследованиям мтДНК европейского населения, источником первой миграционной волны могла быть раса, сложившаяся на Кавказе 25–30 тыс. лет назад и проникшая в Европу в порядке замещения вымирающих неандертальцев 15–20 тыс. лет назад. Одна из ветвей многообразной кавказской расы (возможно, предки нынешних осетин) стала родоначальником древних европейцев, образовавшихся из переселенцев, которые быстро расплодились и перемешались на плодородной и богатой дичью равнине. Этой расе принадлежало все равнинное пространство от Атлантики до южно-уральских степей. Этой же расе пришлось сосуществовать с прежними соседями неандертальцев, обновившими своей генотип в резервациях на Пиренейском полуострове и на юго-западе Франции, вероятно, 30 тыс. лет назад (по анализу маркеров Y-хромосомы) и расплодившихся 10–15 тыс. лет назад (по анализу мтДНК). Следы этой расы остались в генотипах басков и саамов, чья предковая популяция была рассечена на две генетически родственные группы ледником, заставившим людей на многие столетия разделиться между Иберией, Балканами и Северным Причерноморьем.