В сельских районах страны началось партизанское движение, ставшее стихийным ответом масс на продолжавшийся террор банд помещиков-латифундистов. Осенью 1949 г. первые партизанские отряды появились в восточных районах Колумбии, где труднопроходимая местность позволяла им успешно действовать против отрядов наемников, полиции и армейских частей.[1197] В ноябре 1949 г. посол США в Боготе сообщал в госдепартамент о действиях партизан: «террористы обычно организуют три группы: 1) для организации взрывов, 2) поджогов, 3) в качестве ударных отрядов».[1198] В другом документе говорилось о том, что «правительство скрывает истинное положение дел в провинции. Там идут кровопролитные стычки, о которых прессе запрещено сообщать, но некоторые факты время от времени просачиваются на страницы печати. В провинции Льянос, например, оперируют конные банды террористов под предводительством некоего Арбелаеса, и армии не удается подавить их силой».[1199]
Обострение политической обстановки заставило Переса согласится на проведение досрочных президентских выборов в ноябре 1949 г. Кандидатом от Консервативной партии стал Л. Гомес, кандидатом от Либеральной партии – Д. Эчандиа.
Однако вынужденное согласие властей на проведение выборов не повлияло на ситуацию. В стране продолжался террор и вооруженные столкновения, в результате которых только в сентябре-ноябре 1949 г. было убито около 2 тыс. человек.[1200] В подобных условиях о нормальном ходе выборов не могло быть и речи, поэтому Либеральная партия объявила о намерении бойкотировать выборы, а Эчандиа снял свою кандидатуру. В итоге, 27 ноября президентом был избран единственный кандидатконсерватор Л. Гомес, приступивший к исполнению обязанностей в августе 1950 г.
К моменту его вступления на пост, партизанское движение значительно активизировалось в провинциях Толима, Антиокия, Кундинамарка, Бояка, Сантандер-дель-Сур, Уила, Каука, Кальдас, Магдалена и в районах Льянос Ориенталес. Общая численность партизанских отрядов доходила до 30 тыс. бойцов (в конце 1951 г. на сторону партизан перешли сотни солдат, которых готовили для отправки на войну в Корее).[1201] Однако из-за отсутствия единого руководства, партизанские действия носили разобщенный характер. Нередко случалось, что отряды партизан вместо того, чтобы совместно выступить против карателей, пускали в ход оружие друг против друга, «пытаясь таким путем разрешить возникавшие между ними разногласия».[1202]
Левые либералы и коммунисты приняли активное участие в партизанском движении, рассматривая его как «выражение героического сопротивления народа террористическим репрессиям диктатуры и насилию со стороны реакционных банд».[1203] Коммунистическая партия Колумбии выступала за объединение отдельных партизанских отрядов в более крупные соединения, предпринимала попытки наладить связь между отрядами, организовать выпуск партизанской газеты. Но усилия КПК в этом направлении не всегда давали нужный результат. Однако в дальнейшем в Боготе была создана подпольная координационная хунта, «которая должна была наладить взаимодействие между отдельными отрядами, снабжать их оружием, продовольствием и медикаментами».[1204]
Правительственные войска под командованием военного министра У. Арбелаеса провели против партизан крупную карательную операцию. В основные районы партизанского движения были брошены отборные части, в частности батальон спецназначения «Варгас», обученный американскими специалистами по борьбе с партизанами в Юго-Восточной Азии. Войска действовали при поддержке артиллерии, танков и авиации. С целью лишить партизан поддержки местных жителей, солдаты получили приказ расстреливать любого человека, заподозренного в связях с партизанами. Особенными зверствами в отношении мирного населения отличался батальон «Варгас» под командованием полковника Вильямисара.
В результате проведенной операции правительственные войска добились определенного успеха. Партизанские силы оказались рассеянными в разных районах страны, связь между ними была нарушена. Одна часть партизан ушла в труднодоступные горы, другая часть организовалась в бандитские шайки либо бежала в Венесуэлу. Положение партизан осложнялось произошедшими в провинции Толиме вооруженными столкновениями между отрядами, находившимися под влиянием коммунистов и либералов. Эти столкновения, спровоцированные агентами Гомеса, привели к расколу в партизанском движении.
С 1951 г. партизанская война в Колумбии резко пошла на спад. Власти вступили с партизанами в переговоры о добровольной сдаче оружия. Однако переговоры зашли в тупик. В 1952 г. партизанское движение снова начало набирать силу и продолжалось до 60-х гг. XX века.