Война между «Медельинским картелем» и властями страны принесла «интеллигентам» немалые убытки. Безусловно, намного лучше было бы зарабатывать деньги сообща, вражда никогда не дает больших выгод. Но наркобароны клана Кали выбрали в создавшихся условиях другой путь. Они предпочли как можно меньше «светиться», старались не привлекать к себе внимания и скрывать размеры реальных доходов картеля. Заработанные деньги тщательно отмывались и вкладывались в легальный бизнес. Такой путь на данном этапе был куда более эффективным, нежели открытая конфронтация с властями, уносящая множество жизней. Но Эскобар до последнего оставался верным единожды избранному им пути. Он открыто внедрялся в политическую жизнь страны, отчаянно пытаясь подчинить ее своему влиянию.
Обстановка в стране накалялась в связи с приближающимися президентскими выборами. Происшествия на улицах крупных колумбийских городов, свидетельствующие о приближающейся войне, становились все более частыми и кровавыми. Как иронизировала пресса, на выборах 1990 г. голосовали не столько бюллетенями, сколько автоматными очередями. Еще до выборов поплатились жизнью четыре кандидата на должность президента! Общество было буквально шокировано действиями обнаглевшей в конец наркомафии. Темы борьбы с распространением наркотиков звучали в ходе предвыборной кампании из уст практически каждого кандидата, и бандиты сделали все для того, чтобы не допустить выбора на пост президента человека, способного к принятию реальных мер, направленных против наркомафии. Есть сведения, что во время выборов наркоторговцы сотрудничали с праворадикально настроенными военными.
Первым от пуль мафии пал кандидат в президенты Эдуард Дуран Дусан. Вслед за ним на тот свет отправился Луис Карлос Галан, чей рейтинг был необычайно высок: за него собирались отдать свои голоса не менее половины избирателей. Одной из важнейших тем его предвыборной агитации была борьба с ростом влияния наркокартелей. Он отстаивал идею высылки пойманных наркобаронов в США, сознавая, что местные суды вряд ли смогут засадить их в тюрьму, и был ярым противником любого сотрудничества с мафией.
Галан был убит согласно личному распоряжению Эскобара, вынесшего ему свой приговор во время большого предвыборного митинга, проходившего в городке Соача, что в 25 км к югу от Боготы. Зная о грозящей опасности, охранники окружили Галана плотным кольцом. Когда Галан и его охранники поднимались на трибуну, из толпы сразу с нескольких сторон был открыт автоматный огонь. Началась паника, сопровождавшаяся невероятной давкой. Пули приколачивали падающих людей к трибуне будто гвозди. В тот же день от рук мафиози погиб судья Карлос Валенсия, который вел дело Эскобара. В его автомобиль было выпущено в общей сложности около ста пуль.
Благополучно отправив на тот свет крупнейших политиков, мафиози потеряли всякое сомнение в безнаказанности своих действиях. Стрельба на улицах крупных городов раздавалась практически каждый день. Власти явно проигрывали мафии в этой войне. Необходимо было принятие крайних мер. В стране было введено осадное положение, а в Медельине установлен комендантский час. В патрулировании улиц принимали участие 4 тыс. солдат. Верховным судом страны к тому времени было принято решение, приостанавливающее выдачу колумбийских наркобаронов Соединенным Штатам. Но после введения осадного положения решение верховного суда было отменено президентским декретом. Был объявлен розыск Эскобара. Армейским подразделениям был отдан приказ начать против мафии открытые боевые действия. Наркобароны были вынуждены скрыться в своих секретных убежищах: сопротивляться массированному наступлению регулярных войск не хватало силы даже у них.
За две недели в результате успешных операций войсковым частям удалось захватить около 550 поместий, квартир, гостиниц, особняков, дискотек, являвшихся собственностью наркомафии. Среди них были и 42 фазенды — нечто вроде огромных вотчин в Магдалине-Медио.
Благодаря армейским операциям был захвачен целый арсенал оружия, которого хватило бы на батальон солдат. У мафии были конфискованы 1356 автомобилей, 142 мотоцикла, 349 самолетов, 18 вертолетов, 33 яхты, системы радиосвязи и телекоммуникаций, радары и многое другое, как нельзя лучше свидетельствующее о том могуществе, которого она достигла в Колумбии. Что касается самого кокаина, то его тоже обнаружено было немало — около 5 т.
Под арест попали и несколько крупных наркомафиози, в первую очередь Эдуардо Мартинес Ромеро, считавшийся казначеем «Медельинского картеля». Не давая Ромеро никаких шансов вновь обрести свободу, его тут же посадили на самолет о отправили в США, где он вскорости был приговорен к пожизненному заключению.