8 февраля 1943 года — особый день в истории полка. В этот день Приказом НКО № 64 два полка — 2-й и 40-й АПДР ГК КА — «…за проявленные отвагу, стойкость, дисциплину и организованность, за героизм личного состава в боях с немецкими захватчиками преобразованы, соответственно, в 47-й и 48-й Гвардейские АПДР ГК КА». 17 февраля 1943 г. на аэр. Монино в торжественной обстановке представитель Ставки ВГК генерал-майор Машнин и начальник Разведуправления ВВС КА генерал Грендаль вручили командиру полка гв. п/п-ку Тюрину Гвардейское Знамя. Весь личный состав, находившийся в Монино, и представители оперативных групп с других аэродромов повторили за командиром Клятву Гвардейцев: «…Клянемся, что врученное нам Гвардейское Знамя мы покроем славой и воинской доблестью, и с гордостью пронесем его на запад до полного разгрома немецких захватчиков».
Ржевско-Вяземскую операцию обеспечивали группа 1-й АЭ из Мигалово, оперативная группа 3-й АЭ из Андреаполя и 2-й АЭ с аэр. Монино. Ночная разведка велась как по переднему краю, так и в глубоких тылах противника. Всего в ходе обеспечения этой операции выполнено 463 б/в.
1 марта 1943 г. в полку сформировали 4-ю АЭ на самолетах Пе-2, ее командиром был назначен гв. к-н Викторов.
14 марта 1943 г. предстояло сфотографировать передний край обороны противника под Старой Руссой — район прикрывался плотным зенитным огнем и истребителями. Выполнять задание вылетел на Ту-2 экипаж зам. ком. АП гв. м-р Столярова. На земле получили радиограмму: «Задание выполнено, возвращаемся. Машина исправна». После этого связь с самолетом пропала, и на аэродром он не возвратился. А еще через два дня вернулся штурман Хабеев, который рассказал, что «тушка» подверглась нападению истребителей FW 190, которым удалось поджечь Ту-2. Комадиру пришлось дать команду покинуть самолет. Штурмана подобрали наши саперы, а судьба гв. м-ра Столярова и стрелков гв. старшин Башука и Бачкова осталась неизвестной.
Это была первая боевая потеря на Ту-2, а до конца года полк потерял еще четыре «тушки» (6.07, 19.07, 26.07, 2.08) — все в течение одного месяца, когда противник в ходе Орловско-Брянской операции начал использовать на этом участке фронта истребители FW 190. В течение года в полк поступало пополнение, и даже несмотря на то, что выпуск Ту-2 был прерван, и с учетом боевых потерь, к 1 декабря 1943 г. в 1-й АЭ было 6 таких самолетов.
Несмотря на потери, летчики полка очень высоко оценили новый разведчик — в отчете о фронтовых летнобоевых испытаниях, проводившихся при выполнении боевых заданий с марта по ноябрь 1943 г., отмечалось: «В самолете Ту-2 с моторами АШ-82 правильно разрешена тактическая схема современного разведчика. Положительными свойствами самолета являются:
1. Большая дальность полета и радиус действия в 1,5–2 раза превышающие этот же показатель у самолетов Пе-2 и Пе-3;
2. Двигатели воздушного охлаждения повышают живучесть самолета по сравнению с моторами жидкостного охлаждения на Пе-2 и Пе-3;
3. Хорошая схема оборонительного боя;
4. Возможность выполнения полета на одном двигателе;
5. Экипаж самолета — 4 человека, 3 из которых могут вести оборонительный бой;
6. Легкость освоения самолета летным составом;
7. Наличие на разведчике новых фотоустановок — трехмаршрутных качающихся установок АКАФУ».
Несмотря на такие оценки, в 1943 г. выпуск Ту-2 прекратили…
4 мая 1943 г. на основании директивы ГШ КА в полку на базе особой авиационной группы Разведуправления ГШ КА и ЦК ВКП(б) была сформирована 5-я ночная транспортная эскадрилья в составе 6 самолетов Ли-2, выполнявшая специальные задачи ГРУ и Ставки по переброске разведчиков и специальных грузов в глубокий тыл противника. Эскадрилья выполняла самые разнообразные задачи, не связанные с секторами боевых действий полка, достигая рубежа Рига-Вильно-Волковыск-Кобрин-Житомир-Умань-Николаев. Командиром АЭ стал к-н Дудкин, а после его гибели 14 августа 1943 г. — гв. м-р Цуцаев.
Почти одновременно с 5-й АЭ сформировали 6-ю АЭ, принявшую на себя нелегкую задачу подготовки боевых экипажей (ранее этим занималась 2-я АЭ) на Пе-2 и УПе-2, а 2-я АЭ смогла полностью переключиться на боевую работу.
Весной и летом 1943 г. эскадрильи полка участвовали в подготовке и проведении Орловско-Брянской операции на Курской дуге. Разведка велась с аэродромов совхоз Дугино (1-я АЭ), Монино (2-я АЭ), Андреаполь (3-я АЭ), Вязьма (4-я АЭ) — 333 дневных и 102 ночных боевых вылетов. Цменно этот период в истории полка связан с наибольшими потерями. Чаще всего в журнале боевых потерь стоят записи: «Пропали без вести».