Модернизированный перехватчик получил обозначение МиГ-25ПД (изделие «84Д») — «доработанный».
Внешне МиГ-25ПД отличались удлиненной носовой частью фюзеляжа, иным местоположением люков для доступа к блокам РЛС, а также наличием под носом теплопеленгатора. Машины оснащались модернизированными двигателями Р15БД-300.
Официально серийный выпуск этой модификации продолжался до 1982 г., однако несколько машин плана 1982 г. были достроены заводом только в 1983 г.
Так как МиГ-25ПД оказался существенно эффективней МиГ-25П, в ОКБ решили переоборудовать ранее выпущенные модификации «П» по типу «ПД». Для этого с 1979 г. машины перегонялись из авиаполков на Горьковский авиазавод, где их в процессе капремонта оснащали новым оборудованием и двигателями. Доработанные таким образом перехватчики получали обозначение МиГ-25ПДС («перехватчик, доработанный встрою») и теперь практически уже ничем не отличались от серийных МиГ-25ПД. Перевод «П» в «ПДС» (как и выпуск «ПД») продолжался до 1982 г.
Выпуск серийных разведчиков МиГ-25Р (изделие «02») Горьковский авиационный завод начал в 1969 г. При их производстве были учтены многие замечания, выявленные при испытаниях и на ранней стадии эксплуатации. Позднее практически все самолеты этой модификации дорабатывались и получали другое обозначение.
Как и в случае с МнГ-25ПД, к доработке разведчиков подвигли внешнеполитические события. Египет и Сирия, с которыми у СССР была «братская дружба», обратились с просьбой к руководству страны предоставить нм оружие с тем, чтобы они могли ответит! на агрессию Израиля. В конце 1969 г. Министр Обороны Д. Ф. Устинов поставил перед ОКБ А. И. Микояна задачу — в течение нескольких недель переоборудовать разведчики в разведчики-бомбардировщики. Работы начались немедленно. Оборудование разведчика откорректировали и дополнили в соответствии с новыми задачами. Самолет получил обозначение МиГ-25РБ (изделие «02Б») — «разведчик-бомбардировщик».
Кроме того, что авиазавод в Горьком доработал до стандарта «РБ» несколько машин модификации «Р», после необходимых проверок и испытаний с 1970 г. он начал выпуск самолетов в варианте разведчика-бомбардировщика.
На первых серийных МиГ-25РБ бомбы (до 2000 кг) подвешивались только под фюзеляжем (4хФАБ- 500М-62). Позже, с установкой крыльевых балочных держателей, максимальная бомбовая нагрузка возросла до 4000 кг. Были попытки довести ее и до 5 т, но при этом самолет сильно терял в высотности и скорости. Примерно со второй половине 70-х годов на МиГ-25РБ отказались от подвесных и килевых баков.
МиГ-25РБ выпускался в течение двух лет, а с 1972 года на его базе начали строип» более совершенные модификации.
Решение о разработке МиГ-25РБК (изделия «02К») было принято одновременно с решением о создании МиГ-25Р, так как фотооборудование модификации «Р» позволяло разведать лишь общую радиотехническую обстановку (есть станции или нет). С установкой аппаратуры легальной радиотехнической разведки «Куб-3» (а позже — «Куб-ЗМ») новая модификация могла уже «вычислять» координаты излучающих средств и оперативно передавать их на командный пункт. Вооружение — аналогичное «РБ».
Габариты и вес нового оборудования были таковы, что часть фотокамер пришлось снять, а оптические люки закрыть металлической обшивкой. После успешно проведенных испытаний МиГ-25РБК строился в Горьком серийно с 1971 по 1980 г. С 1981 г. на самолеты стали устанавливать еще более совершенное разведоборудование.
Почти одновременно с МиГ-25РБК, в 1971 г., в серию запустили другой разведчик — МиГ-25РБС (изделие «02С»). Он отличался наличием на борту радиолокационной станции бокового обзора «Сабля». Опытно-конструкторские работы по новой станции велись с 1963 г. Внешне «РБС» отличался наличием больших панелей из радиопрозрачного материала по бокам носовой части фюзеляжа. Бомбардировочное вооружение и оборудование — как на «РБ».
Самолет строился серийно до 1977 г. Позже часть МнГ-25РБС переоборудовали более совершенной аппаратурой.
Появление новой модификации — МиГ-25РБВ (изделие «02В») — связано с заменой на серийных разведчиках-бомбардировщиках МиГ-25РБ станций СРС-4А и СРС-4Б на усовершенствованную СРС-9 «Вираж». Работа проводилась с 1978 г.
В этом же году вместо станции общей радиотехнической разведки «Вираж» на разведчики стали устанавливать станцию «Тангаж» с большим диапазоном частот и типов разведуемых РЛС. Модификация стала называться МиГ-25РБТ (изделие «02Т»).