Хессу не удалось наладить домашнюю послевоенную жизнь с родными, и он поступил на службу в Добровольческий корпус Россбаха. Он служил на востоке и 28 июня 1923 г. был арестован за участие в убийстве коммунистического шпиона. 15 марта 1924 г. Хесс был приговорён к десяти годам тюрьмы. 14 июля 1928 г. был амнистирован. Хотя у него и был короткий период умственного расстройства, Хесс получил репутацию примерного заключённого.
После освобождения Хесс провёл десять увлекательных дней в Берлине в компании с друзьями, перед тем как устроиться на ферму. Он полагал, что национал-социализм будет лучше всего служить интересам Германии, и уже в ноябре 1922 года в Мюнхене Хесс становится партийным членом № 3240. В 1928 году он вступил в фермерское братство Артаманена, к которому также принадлежал и Гиммлер. В 1929 году он женился и по настоянию Гиммлера вступил в СС. В 1934 он согласился служить в концентрационном лагере Дахау.
С самого же начала Хесс был поражён царившей в Дахау враждебной холодностью по отношению к заключённым, которая внушалась охранникам-эсэсовцам местным комендантом, впоследствии заменённым. Хесс сам когда-то был заключённым и смотрел на вещи с точки зрения последнего. Несмотря на это, он полагал, что концлагеря являются необходимым промежуточным этапом на пути консолидации национал-социализма. Его очень привлекала чёрная эсэсовская форма, являвшаяся символом качества и престижа. Через несколько лет его перевели в Заксенхаузен, где царила более благоприятная атмосфера.
Начало войны от 1939 года принесло новый этап в лагерную службу эсэсовцев. Враги Германии поклялись уничтожить национал-социалистический рейх. Это было вопросом жизни и смерти, а не просто судьбой нескольких земель. Эсэсовцы должны были удерживать бастионы порядка перед тем, как снова наступит мир и будет выработан новый свод законов. Высокопоставленный эсэсовский офицер, чья халатность привела к побегу одного важного заключённого-коммуниста, был казнён его сослуживцами по прямому приказу Гиммлера. Это убедило всех эсэсовцев из Заксенхаузена в серьёзности ситуации. Некоторые из заключённых были амнистированы в 1939 году, согласившись служить в немецких вооружённых силах.
В 1939 году произошёл неприятный случай. Несколько профессоров из Краковского университета были доставлены в Заксенхаузен. Однако несколько недель спустя они были освобождены после вмешательства Геринга. В Заксенхаузене Хесс имел обширные контакты с пастором Мартином Нимёллером (Martin Niemoeller) — широко уважаемым противником национал-социализма.
В начале 1940 года Хесс с большими надеждами отправился в Освенцим. Там пока ещё не было лагеря, но он надеялся организовать полезный лагерь, который бы внёс важный вклад в германскую военную промышленность. Он всегда был чувствительным идеалистом в отношении условий заключения и надеялся установить для будущих заключённых такие условия проживания и содержания, какие были бы как можно более удовлетворительны для военного времени. В начале работы по организации лагеря Хесс столкнулся с раздражающей бюрократической волокитой и нехваткой ресурсов. Также он резко критиковал недостаточный профессионализм многих своих сослуживцев.
В течение первых двух лет польские военнопленные составляли наибольшую отдельную группу в лагере, хотя много узников было также доставлено в Освенцим из Германии. В конце 1941 года стали прибывать русские военнопленные. Они находились в жалком состоянии после длительного пути. С середины 1942 года евреи стали составлять в лагере основную долю. Хесс вспоминает, что в ранние дни системы небольшие группы евреев, находившихся в Дахау, были очень довольны их привилегиями в столовых. Что касается Заксенхаузена, то там практически не было евреев.
И вот как раз с этого момента повествование Хесса — до сих пор правдоподобное — становится крайне сомнительным. Манера, в которой описывается якобы имевшее место преднамеренное уничтожение евреев, очень поразительна. Из еврейских заключённых якобы создаётся особый крупный отряд. Эти мужчины и женщины берут в свои руки контроль над узниками — как новоприбывшими, так и находящимися на территории лагеря, — отобранными для умерщвления. Роль СС ограничивается общим надзором и подачей газа циклона-Б через душевые головки так называемых камер уничтожения.