И.В. Сталин считал одной из причин неудач не только на западном, но и на других направлениях, то, что многие бойцы и командиры не проявляли необходимой стойкости. В директиве № 001919, написанной 12 сентября начальником Генштаба Маршалом Советского Союза Б.М. Шапошниковым под диктовку Верховного Главнокомандующего, предписывалось создать в каждой стрелковой дивизии «заградительный отряд из надежных бойцов, численностью не более батальона (в расчете по 1 роте на стрелковый полк). Он, находясь в подчинении командира дивизии, имел в своем распоряжении, кроме обычного вооружения, средства передвижения в виде грузовиков и несколько танков или бронемашин. Задачами заградительного отряда являлись: оказание прямой помощи комсоставу в поддержании и установлении твердой дисциплины в дивизии; приостановка бегства одержимых паникой военнослужащих, не останавливаясь перед применением оружия; ликвидация инициаторов паники и бегства; поддержка честных и боевых элементов дивизии, не подверженных панике, но увлекаемых общим бегством. От работников особых отделов и политсостава дивизий требовалось оказывать всяческую помощь командирам дивизий и заградительным отрядам в деле укрепления порядка и дисциплины{103}.
После завершения Смоленского сражения по решению Сталина Маршал Советского Союза Тимошенко 11 сентября был назначен главнокомандующим Юго-Западным направлением вместо Маршала Советского Союза Буденного. На освободившуюся должность командующего Западным фронтом по предложению генерала армии Жукова 12 сентября назначается генерал-полковник Конев[28]. Ему предстояло остановить «Тайфун»[29] — такое наименование носила операция по окружению Москвы.
Согласно директиве № 35, подписанной 6 сентября Гитлером, войска группы армий «Центр» должны были в конце сентября перейти в наступление и «уничтожить противника, находящегося в районе восточнее Смоленска, посредством двойного окружения в общем направлении на Вязьму при наличии мощных танковых сил, сосредоточенных на флангах». После разгрома основных сил войск Западного стратегического направления намечалось перейти к их преследованию на московском направлении, примыкая правым флангом к р. Ока, а левым — к верхнему течению Волги. При этом группе армий «Юг» предписывалось выдвинуть подвижные соединения на северо-восток для прикрытия с юга главных сил группы армий «Центр», а обеспечение их с севера возлагалось на группу армий «Север»{104}.
В соответствии с директивой № 35 командующий группой армий «Центр» и его штаб приступили к подготовке и планированию операции «Тайфун». В директиве № 1300/41 от 16 сентября отмечалось, что переход в наступление предусматривается не позже начала октября{105}. К этому времени планировалось усилить 4-ю и 9-ю армии с подчиненными им 4-й и 3-й танковыми группами с таким расчетом, чтобы «каждая из армий при помощи сильной атакующей группы, состоящей из моторизованных, танковых и пехотных соединений, смогла бы осуществить прорыв обороны противника по обе стороны дороги Рославль, Москва и севернее автодороги; уничтожить зажатые между внутренними флангами войска противника». Для этой цели они должны были, прикрывшись с востока в зависимости от обстановки, «совершить поворот либо против общей линии Вязьма, Дорогобуж, или с обеих сторон к Вязьме».
24 сентября в штаб группы армий «Центр», находившийся в районе Смоленска, прибыл начальник Генерального штаба Сухопутных войск генерал-полковник Гальдер. Он вместе с генерал-фельдмаршалом фон Боком обсудил замысел операции «Тайфун». Фон Бок сообщил, что планирует 30 сентября начать наступление в полосе 2-й танковой группы, а на остальных участках — 2 октября.