Физическая боль является важной и интегральной частью психоделического процесса и также, если она появляется на сессии, должна быть испытана во всей полноте. Обычно она возникает в контексте переживания реальной физической травмы, такой как болезнь, авария или операция, или родовая травма, хотя она также может иметь различные символические значения. Сильная физическая боль может иногда быть связанной с различными трансперсональными явлениями, такими как прошлые воплощения или филогенетическая память. На последних стадиях сессии, когда фармакологический эффект препарата уже ослабел, полезно усилить ощущения при помощи надавливаний или глубокого массажа в местах, указанных пациентом. При работе с болью ситтеры должны поощрять полноценное переживание боли и любое выражение той эмоции, которая неизбежно стоит за ней. Достаточно часто пациенты просят, чтобы их сдавливали иногда даже сильнее, чем терапевт может допустить. Под профессиональным присмотром индивиды могут пытаться причинить себе вред для того, чтобы вывести боль наружу. Кажется, именно этот механизм лежит в основе случаев причинения себе травмы в ходе ЛСД сессий, которые так активно обсуждались в средствах массовой информации.
Тошнота и рвота часто случаются у людей, которые страдали от этой проблемы в детстве, или для которых эта реакция типична для стрессовых ситуаций в повседневной жизни. Тошноту не следует облегчать никакими средствами, и ситтеры должны поощрять рвоту, если пациент пытается с ней бороться. Извержение рвотных масс имеет мощный очистительный эффект и во многих случаях знаменует переломный момент сложной ЛСД сессии. Оно может быть очень важным для людей, у которых есть очень сильный негативный заряд этой ситуации в повседневной жизни. Отказ от рвоты может представлять собой очень важный блок и может быть связан с мощным эмоциональным материалом на разных уровнях. После приступа рвоты в середине ЛСД сессии некоторые пациенты говорят о том, что они избавились от мусора. Другие чувствую, что они сбросили с себя внутренний образ плохого родителя. В некоторых случаях активная рвота может быть связана с чувством того, что из тела выходят чуждые энергетические сущности, что во многом напоминает экзорцизм.
Проблемы, связанные с мочеиспусканием и дефекацией необычно часты на психоделических сессиях. Они принимают форму как уретральных и анальных спазмов и невозможности помочиться или избавиться от каловых масс, так и сильного физиологического желания облегчиться и страха потерять контроль над мочевым пузырем и прямой кишкой. Сложности с уринацией обычно случаются у людей, которые в своей повседневной жизни реагируют на различные стрессы частыми мочеиспусканиями или демонстрируют классические фрейдистские характеристики уретральной личности, такие как преувеличенные амбиции, озабоченность о престиже, предрасположенность к стыду и страх ошибки. Если ЛСД субъект страдал от проблем с энурезом в прошлом, рано или поздно можно ожидать этих же проблем и на сессии. Это особенно верно для женщин, которые страдают от фригидности, связанной со страхом потерять контроль над мочевым пузырем во время оргазма. На психодинамическом уровне уретральные проблемы связаны со специфическим травматическим биографическим материалом в соответствии с психоаналитической теорией. Однако они всегда имеют более глубокие корни в родовых переживаниях; существует связь между уретральной дисфункцией и определенными перинатальными матрицами. Так блокирование уринации встречается в контексте БПМ II, болезненная жажда облегчиться и конфликты, связанные с этим, являются стандартными компонентами БПМ III, а потеря контроля над мочевым пузырем характеризует переход от БПМ III к БПМ IV.