В то же время бортовые башни орудий калибра 210 мм необходимо было установить как можно дальше от палубной надстройки и мостика, чтобы при стрельбе в самой надстройке и боевой рубке не создавать излишнего шумового эффекта и ударной волны. Это можно было сделать только при размещении башен над котельным отделением. Поскольку только между котельным и машинным отделениями имелось место для погребов боезапаса бортовых башен, эти погреба разместили в районе задней пары бортовых башен.
Доставка боезапаса к передней паре бортовых башен осуществлялась через специальный сквозной проход вдоль диаметральной плоскости корабля на броневой палубе. Два подъёмника снабжали снарядами и зарядами все четыре бортовые башни, что оказалось неудачным конструктивным решением и в бою привело к роковому исходу.
Но, поскольку тяжелый крейсер "Е" должен был использоваться как учебный артиллерийский корабль для проведения опытных артиллерийских стрельб, его построили с этим дефектом, чтобы выявить преимущества и недостатки проекта. Это решение определило трагическую судьбу "Блюхера".
Стапельный период постройки корабля составил 13 месяцев, достройка на плаву почти 18 месяцев. После почти трехлетней постройки, по сравнению с двухлетней постройкой английского "Инвинсибла", "Блюхер" был готов к испытаниям и предварительно вошел в состав флота 1 октября 1909 г. В немецком военно-морском флоте дата начала проведения испытаний считается датой предварительного вступления в состав флота.
Обширные ходовые и другие испытания, которые обычно проводятся после постройки каждого нового корабля и их завершение считалось датой окончательного вступления в состав флота. Испытания "Блюхера", первым командиром которого стал капитан 1-го ранга фон Россинг, продолжались так долго, что крейсер лишь 27 апреля 1910 г. вступил в состав флота.
Стоимость его постройки составила 28 532 тыс.марок или 14 266 тыс. рублей золотом.
Кораблем командовали: капитан 1-го ранга фон Россинг (ноябрь 1909 г. – сентябрь 1910 г.), капитан 1-го ранга Шейдт (сентябрь 1910 г. – апрель 1911 г.), капитан 1 -го ранга Трендтел (апрель 1911г. – сентябрь 1911 г.), капитан 1-го ранга Пипер (сентябрь 1911 г. – сентябрь 1913 г.), фрегатен- капитан Эрдман (октябрь 1913г. – январь 1915 г.).
Интересно то, что в 1910 г. в связи с намерением Турции купить немецкие боевые корабли в прессе появилось сообщение, что возникал вопрос и о продаже "Блюхера". Тогда все же остановились на продаже только броненосцев "Курфюрст Фридрих Вильгельм" и "Вайзенбург".
Войдя в состав флота, "Блюхер" тотчас же стал (вместо броненосного крейсера "Йорк") флагманским кораблем разведывательного отряда под командованием вице-адмирала Хейрингена. В составе флота, когда не проводились артиллерийские стрельбы, он использовался как головной крейсер разведывательных сил. Кроме него в состав разведывательного отряда входили следующие корабли: броненосный крейсер "Гнейзенау", легкие крейсера "Данциг" (до 6 июня), затем "Майнц". "Кенигсберг", "Дрезден", броненосные крейсера "Роон" (флагманский корабль 2-го флагмана контр-адмирала Бахмана), "Йорк", легкие крейсера "Берлин", "Любек", "Штеттин".
П осле обычных летних учений флота состоялся поход в Норвегию. Осенью последовали значительные изменения в составе командования разведывательного отряда. Командующим разведывательным отрядом был назначен контр-адмирал Бахман, на его место 2-го флагмана отряда вскоре пришел контр-адмирал граф фон Шпее, поднявший свой флаг на борту "Йорка". Кроме того, броненосный крейсер "Гнейзенау" вывели из состава отряда и отправили в поход в Восточную Азию.
С 1911 г. протекала нормальная, без особых происшествий служба "Блюхера" в составе флота. В этот год артиллерийской боевой части корабля под командованием капитан-лейтенанта Клаппенбаха удалось завоевать приз кайзера за лучшую на флоте артиллерийскую стрельбу. В феврале 1911г. первый немецкий линейный крейсер "Фон-дер- Танн" вошел в состав флота. 28 сентября 1911 г. он стал флагманским кораблем отряда вместо "Блюхера", который отныне, как и намечалось, должен был найти применение в качестве опытного артиллерийского корабля и был приписан к инспекции корабельной артиллерии. Председатель артиллерийской инспекции капитан 1-го ранга Пипер стал одновременно командиром корабля, на борту которого работала эта инспекция.