Депутаты должны были выработать конкретные законы на основе общих принципов, изложенных императрицей в написанном ею «Наказе». Екатерина не скрывала, что ее труд являлся компиляцией в основном двух источников – сочинения французского просветителя Ш.Л. Монтескье «О духе законов» и трактата итальянского юриста-криминалиста XVI в. Ч. Беккариа «О преступлениях и наказаниях». Некоторые элементы политико-правовой концепции Екатерины, по меркам русской жизни, были столь радикальны – прежде всего осуждение ею крепостного права как бесчеловечного и противоречащего разумной организации общества, – что ей пришлось после прочтения первоначального варианта «Наказа» приказать ближайшему окружению сократить текст, изъяв из него самые острые места.
В процессе работы Комиссии обнаружились серьезные разногласия по вопросам о крепостном состоянии крестьян, о праве дворян заниматься торговлей, о притязаниях купцов на право владеть крепостными и т. д. Продолжавшиеся в течение полутора лет дебаты лишь познакомили императрицу с реальным состоянием дел в стране и запросами сословий, а практического результата в виде новых законов не дали. В январе 1769 г. под предлогом войны с Турцией деятельность Комиссии была приостановлена. Больше в полном составе она не собиралась. Екатерина поняла невозможность сразу переделать законодательство и необходимость реформировать государственную администрацию постепенно.
На практике главным направлением реформирования государственного аппарата стала некоторая децентрализация управления, то есть перераспределение функций от центральных правительственных учреждений к местным – губернской и уездной администрации.
В 1763 г. был реформирован Сенат. Он лишился своей главной функции – законодательной инициативы и утратил свое политическое значение. Он стал лишь высшей судебно-апелляционной инстанцией. Законодательная инициатива перешла исключительно к императрице. Начиная с 1775 г. проводилась в жизнь губернская реформа. Россия была разделена на 50 губерний по 300–400 тыс. жителей в каждой, губернии делились на уезды – по 20–30 тыс. Губернию возглавлял назначенный губернатор, иногда 2–3 губернии объединялись под властью генерал-губернатора, подчинявшегося только императрице. Помощниками губернатора были вице-губернатор, два губернских советника и губернский прокурор. Это губернское правление и ведало всеми делами: вице-губернатор возглавлял казенную палату (доходы и расходы казны, казенное имущество, откупа, монополии и т. д.), губернский прокурор ведал всеми судебными учреждениями. В городах вводилась должность городничего. В губернских городах создавались приказы общественного призрения, ведавшие школами, приютами, больницами. В уезде власть принадлежала избираемому дворянским собранием капитан-исправнику.
Создана была система сословного суда: для каждого сословия (дворян, горожан, государственных крестьян) свои особые судебные учреждения. Созданная губернской реформой 1775 г. система местного управления сохранилась до 1864 г., а введенное ею административно-территориальное деление – до 1926 г.
Екатерина стремилась усилить личностный характер власти в империи. Важнейшим звеном государственного управления стала ее личная канцелярия – Кабинет. Реальная власть все больше сосредоточивалась в руках екатерининских вельмож, пользовавшихся доверием императрицы (И.И. Бецкой, Г.А. Потемкин, К.Г. Разумовский, А.А. Безбородко и др.). С течением времени обнаружилась необходимость в создании совещательного совета при императрице. Такой Императорский совет был создан в 1769 г. и собирался по мере надобности.