В то время Европа находилась во власти астрологов, магов, тайных организаций; оккультизм расцветал пышным цветом. В моду входили отравители. Карлу IX, который перед своей смертью посетил Нострадамуса, подсунули пропитанную ядом книгу, бездыханным пал Хуан Австрийский, надев башмаки. Женские помады также содержали яд. Считают, что Генриха Наваррского отравила поцелуем госпожа де Сов. Мистически охотясь на королей и пэров, изготавливали восковых кукол, всаживая в них иглы. В такое время появился на свет Мишель.
Он родился 14 декабря 1503 года в маленьком французском городке Сен—Реми. Его отец — Жак ле Нотрдам, мать — Рене де Сен—Реми.
Он происходил, вопреки расхожему мнению, не из семьи медиков, а из семьи торговцев зерном. Лишь его прадед по отцовской линии, Абрам Соломон, был придворным лейб—медиком. Он служил у генерала Калабрии. Поскольку мальчик был выходцем из среднего класса, ему были свойственны такие черты характера, как бережливость, практичность, умение экономить. Несмотря на это, его семья не поскупилась на образование старшего сына. В их роду было много талантливых людей; отец Мишеля был также замечательно одаренным человеком, и свои первые уроки сын получил именно от него. После его отправили в Авиньон, где он изучал философию и получил звание магистра искусств. Затем он отправился в Монпелье изучать медицину. В этом заведении разрешалось анатомировать трупы. Разрешение это дал герцог Анжуйский.
В 1534 году Мишель получает степень доктора медицины и приступает к официальной врачебной практике. Наследство же, которое Мишель получает от отца, было равно… пяти флоринам. Остальные деньги он потратил на учебу. Медицина того времени была на крайне низком уровне. Люди ничего еще не знали о бактериях, микроорганизмах; микроскоп был изобретен лишь в XVII веке. Никто из врачей и предположить не мог, что многие заболевания распространяются воздушно—капельным путем. Незнание микробиологии делало даже вскрытие трупов бессмысленным занятием. Самым популярным действием было кровопускание. Тогда среди медиков существовало разграничение на собственно врачей и знахарей; именно знахари проводили операции: вскрывали абсцессы, вправляли вывихи. Хирургические операции проводились без наркоза, кроме того, без соблюдения правил санитарии и гигиены. Врачи не оперировали — это считалось грязным делом: они выписывали порошки и микстуры. Кроме того, они читали «умные» книги Аристотеля и Гегеля. Врачи, впрочем, не были виноваты в том, что медицина находилась на таком уровне.
Дети короля Франциска I умерли от неизвестных болезней, и их не могли спасти. Сам король умер от туберкулеза; при вскрытии его обнаружились еще много других болезней. И это в семье королей? Что же говорить о простых людях. Потому врачи фигурировали как дармоеды, бессильные помочь кому—нибудь и при этом делающие умную мину. Но уже и в те времена было много талантливых прогрессивных умов, в том числе Парацельс, Авиценна, Джироламо Фракасторо, Мигель Сервет и др.
В 1536 году Мишель поселился в Ажене, точнее в его предместьях. Там он в первый раз женился на Генриетте Д\'Энкосс, от которой, по легенде, у него рождается двое детей. Там же он знакомится с ученым Скалигером, который становится его другом и учителем. Жюль Сезар Скалигер — ученый, врач, гуманист, филолог, литературовед, критик; он занимался исследованием древних античных текстов. Его именовали Французским Эразмом. Общение с этим человеком оказало огромное влияние на формирование мировоззрения Мишеля. В 1552 году он написал о нем: «Человек сведущий и ученый. личность, которую я не знаю, с кем можно сравнить, кроме Плутарха или Марка Варрона».
Семейная идиллия Мишеля недолга — через два года после свадьбы Генриетта умирает от неизвестной болезни. Беда не приходит одна — родители жены потребовали возврата половины приданого, а также он получает приказ от инквизитора Тулузы явиться для разбирательства в связи с его высказываниями. В это же время он порывает со Скалигером.
После всех этих ударов судьбы Мишель решается на отъезд из Ажена.
Период странствий продолжается девять лет. Об этих годах известно мало. Его в это время видели в разных городах: Венеции, Бордо, Турине, Эльзасе, Лионе.
Существует легенда о том, что Нострадамус был гениальным врачом и якобы вылечивал от чумы целые города, но это не так: он был врачом своего времени, боролся с чумой, применяя свои таблетки, приготовленные из лепестков роз, опилок зеленого кипариса, ароматического тростника. При эпидемии шарики из этих ингредиентов полагалось держать во рту. Летучие ароматизаторы «отгоняли» инфекцию, и многие, применяющие их, не заражались чумой, в борьбе с которой в 1544 году принимает участие Мишель. Это было в Марселе.