До этого драматического происшествия Цезарь предпочитал делать вид, что держится в стороне от происходящих событий, осматривая городские достопримечательности и посещая диспуты ученых. Теперь же он с удвоенной силой стал разъяснять и проводить в жизнь свою миссию третейского судьи. Дело тогда завершилось показным примирением между царственными братом и сестрой, в честь чего был устроен пир. Цезарь решил закрепить перемирие, объявив, что Кипр, аннексированный римлянами десять лет назад, возвращается Птолемеям. Однако он передал этот остров во власть двух других наследников – Арсинои IV, с которой Клеопатра была во вражде, и Птолемею XIV, которому было всего одиннадцать лет. Таким путем Цезарь хотел снискать расположение александрийцев. Правда, для Клеопатры это событие было, по понятным причинам, не так уж приятно. Возможно, римлянин объяснил ей, что это – лучший способ убрать Арсиною с дороги. Однако оба новых правителя Кипра на время кризиса были на всякий случай оставлены во дворце под присмотром Цезаря. В любом случае последний сделал удачный ход. Возвращение территории, находившейся уже под управлением римлян, пусть это было и формальностью, не могло не смягчить антиримской критики в Александрии.
Царский квартал, находившийся в восточной части Александрии, тянулся на милю вдоль берега моря. Он занимал от одной четверти до одной трети площади всего города. Здесь находилось множество храмов и садов, украшенных статуями. Среди цветов и деревьев стояли здания мусейона и библиотеки, казармы царских гвардейцев, усыпальницы Александра и Птолемеев. Над всем эти господствовало стоявшее на берегу здание царского дворца, по-видимому самое великолепное и элегантное в Древнем мире. Определенное представление об этой резиденции царей может дать дворец эллинистических времен, открытый во время недавних раскопок в Македонии. Правда, это была отдельно стоящая царская резиденция, Александрийский же дворец представлял собой, по сути, дворцовый комплекс, вроде резиденции китайских императоров в Пекине или султанов в Стамбуле. Во время описываемых событий, согласно официальному ритуалу, Цезарь и Клеопатра (хотя они много времени проводили вместе), как и Птолемей XIII, имели резиденции в разных корпусах дворца, и у каждого из них была своя свита. Среди приближенных юного царя главенствовал по-прежнему Потин. Свита Клеопатры была тогда наиболее скромной. Потому что мало кто из александрийской знати ее поддерживал.
После торжественного примирения царя и царицы могла состояться формальная церемония бракосочетания брата и сестры, если этого не произошло на более раннем этапе их беспокойного совместного царствования. Однако уже к концу октября стало ясно, что перемирие себя исчерпало. Цезарю стало известно, что Потин (возможно, с ведома юного царя) тайно приказал Ахиллу (тому самому, который убил Помпея и продолжал выполнять функции командующего) стягивать войска к Александрии. В середине ноября Цезарю сообщили, что этот Ахилл с 20 тысячами воинов идет на столицу. Это было довольно разношерстное войско, состоявшее из габинианцев, мятежников, преступников, бывших пиратов и беглых рабов. Учитывая пятикратное численное превосходство противника, Цезарь послал за подкреплениями в Сирию и Малую Азию, а также направил к Ахиллу парламентеров – двух ученых мужей Диоскурида и Серапиона, выполнявших важные миссии при Птолемее XII. Однако Ахилл приказал убить парламентеров. Один из них (точно неизвестно, кто именно) действительно был убит, а второй был тяжело ранен, но друзьям удалось спасти его жизнь.