ВЦСПС заботился о совершенствовании методов работы профсоюзов, о том, чтобы было больше живой практической связи руководящих органов с профсоюзными организациями, с массами трудящихся, чтобы глубже изучалась жизнь людей, вырабатывались меры по улучшению дел на производстве и в быту. Успешное решение вопросов производственной деятельности, охраны и оплаты труда, повышения квалификации рабочих, производительности труда и другие — все это также входит в компетенцию министерств и ведомств. Это обстоятельство выдвигало необходимость укрепления отраслевого принципа построения профсоюзов. Эта самая массовая организация трудящихся и называется профессиональными союзами потому, что она объединяет людей по профессиональному, отраслевому принципу.
Вместе с тем все работающие на предприятии, в объединении рабочие и служащие, независимо от профессии объединялись в одной единой профорганизации, кроме того, существовало множество проблем не отраслевого, а регионального характера, это— обеспечение жильем, строительство детских учреждений, медицинское, торговое и другие виды обслуживания. Кроме того, в такой огромной стране, в условиях, когда профсоюзы объединяли почти всех трудящихся, руководить профорганизациями из одного центра крайне затруднительно, поэтому были созданы и руководили профорганизациями на местах республиканские, краевые, областные и городские Советы профсоюзов.
ВЦСПС предпринимал меры для улучшения работы как отраслевых, так и территориальных руководящих профсоюзных органов. Добивался сочетания центрального и регионального руководства профорганизациями.
За период 1956–1967 гг. состоялось три съезда профсоюзов СССР. ВЦСПС, Центральная ревизионная комиссия отчитывались о своей работе. Вносились изменения в устав профессиональных союзов. На съездах подводились итоги проделанной работы, определялись задачи на предстоящий период. Переизбирался состав Центрального Совета. Более половины членов и кандидатов в члены ВЦСПС и Центральной ревизионной комиссии составляли рабочие. Раз в квартал созывались пленумы Совета. На них обсуждались наиболее важные вопросы деятельности профсоюзов, выполнения директив партии, решений профсоюзных съездов, проекты народнохозяйственных планов и другие.
Раз в десять дней проводились заседания президиума ВЦСПС. Заслушивались сообщения о деятельности Комитетов и Советов профсоюзов, об опыте работы профсоюзных организаций на предприятиях и в учреждениях, обсуждались вопросы работы с кадрами, развития социалистического соревнования, борьбы за выполнение производственных планов, роста производительности труда, повышения качества продукции, экономии сырья и материалов, укрепления производственной дисциплины и порядка, улучшения жилищных и бытовых условий, воспитания трудящихся.
Каждую неделю собирался секретариат ВЦСПС. Здесь рассматривались вопросы работы аппарата ВЦСПС, выполнение решений Совета и его президиума, предложения отделов по расстановке кадров, разного рода текущие дела.
ВЦСПС, его президиум и секретариат работали по составляемым на каждый квартал планам. Кроме того, составлялся перспективный план работы на год. Продуманный, четко составленный план помогал руководящим органам ВЦСПС, его аппарату расставить силы, своевременно решать свои задачи, проблемы деятельности профсоюзов.
План работы ВЦСПС направлялся во все Центральные комитеты и Советы профсоюзов. Это помогало им сориентироваться, давало направление в работе, позволяло сконцентрировать внимание и силы на решении наиболее важных задач.
Каждый отдел ВЦСПС на основе общего плана вырабатывал свой план на месяц и квартал, что содействовало организованности, укреплению дисциплины, рациональному использованию работников, повышению результативности работы.
Аппарат ВЦСПС был квалифицированным, укомплектован подготовленными, опытными, знающими дело работниками. Многие из них были специалистами в соответствующих отраслях, имели опыт работы на предприятиях, в учреждениях, в партийных и профсоюзных органах.
Секретариат ВЦСПС постоянно работал с аппаратом. Перед работниками ставились задачи, разъяснялись, подсказывались пути их решения; действовала система по повышению делового уровня и квалификации работников через семинары, курсы, вечернюю и заочную учебу в Высшей школе профдвижения. В аппарате была крупная и сильная партийная организация, она направляла усилия коммунистов, всех работников на успешное выполнение стоящих перед аппаратом ВЦСПС задач, организовывала политическую учебу, вела систематическую работу по идейно-политическому воспитанию работников.
Большое место в деятельности Всесоюзного Центрального Совета профессиональных союзов, его президиума, секретариата и аппарата занимали вопросы расстановки и воспитания кадров. В основе этой работы лежали партийные принципы подбора, выдвижения людей на руководящие должности по политическим и деловым качествам. К руководству профсоюзными органами и в их аппарат выдвигались специалисты своей отрасли, люди, имеющие необходимую подготовку, знание дела, опыт производственной работы.